用kmp算法病毒检测
时间: 2023-12-11 17:30:50 浏览: 156
KMP.zip_DNA_KMP算法
KMP算法可以用于病毒检测。具体步骤如下:
1. 将病毒DNA序列复制一遍,拼接成一个新的字符串。
2. 对新字符串进行KMP算法匹配,匹配的模式串为待检测的DNA序列。
3. 如果匹配成功,则说明待检测的DNA序列中包含病毒DNA序列。
下面是Python代码实现:
```python
def kmp_search(txt, pat):
# 计算next数组
def get_next(pat):
next = [-1] * len(pat)
i, j = 0, -1
while i < len(pat) - 1:
if j == -1 or pat[i] == pat[j]:
i, j = i + 1, j + 1
next[i] = j
else:
j = next[j]
return next
next = get_next(pat)
i, j = 0, 0
while i < len(txt) and j < len(pat):
if j == -1 or txt[i] == pat[j]:
i, j = i + 1, j + 1
else:
j = next[j]
if j == len(pat):
return True
else:
return False
def virus_detection(virus_dna, detect_dna):
# 将病毒DNA序列复制一遍,拼接成一个新的字符串
virus_dna = virus_dna + virus_dna
# 对新字符串进行KMP算法匹配
if kmp_search(virus_dna, detect_dna):
print("检测到病毒!")
else:
print("未检测到病毒。")
# 测试
virus_dna = "ATCGATCG"
detect_dna = "CGATCGAT"
virus_detection(virus_dna, detect_dna)
```
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