row.names(GTEx_GBM_3)<- "gene_name" 错误于`.rowNamesDF<-`(x, value = value): 'row.names'的长度无效

在R语言中，`row.names()`函数用于设置或获取数据框（data frame）或矩阵（matrix）的行名。当你尝试像`row.names(GTEx_GBM_3) <- "gene_name"`这样的语句时，如果出现`'row.names'的长度无效`的错误，通常意味着你试图设置的行名向量（在这个例子中是`"gene_name"`）的长度与当前数据框的行数不符。

例如，如果你的数据框有10行，而你提供的行名只有9个或更多，就会出错。你需要确保新设定的行名向量长度与数据框的实际行数匹配。你可以通过`nrow()`函数来获取数据框的行数，并据此调整你的行名向量：

n_rows <- nrow(GTEx_GBM_3)

# 检查需要的行名长度
if (length("gene_name") != n_rows) {
  stop("Error: Row names length does not match the number of rows in GTEx_GBM_3.")
}

# 更正行名长度
row.names(GTEx_GBM_3) <- rep("gene_name", n_rows)

现在应该可以成功地将所有行名设置为"gene_name"了。

相关问题

我们发现在TCGA数据库中IFIT3mRNA在HNSC中的表达量最高，PRAD中表达量最低；在Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)数据库中lung表达最高，bone表达最低。我们合并TCGA和GTEx数据库以便进一步分析（使用非配对的Wilcoxon Rank Sum and Signed Rank Tests进行差异显著性分析）。由于THYM、 MESO、DLBC、UVM中样本量小于3个， IFIT3mRNA表达差异无法统计。除READ、SARC、UCEC外，我们观察到了IFIT3mRNA在18种肿瘤中显著上调，如BLCA、BRCA、CESC、CHOL、COAD、ESCA、GBM、HNSC、KIRC、LGG、LIHC、OV、PAAD、STAD、SKCM、THCA、TGCT、UCS。我们在8种肿瘤中观察到了显著下调如LUAD、LUSC、KIRP、KICH 、PRAD、PCPG 、ACC、LAML。以上文字使用nature杂志的风格翻译成英文

回答:
我们在TCGA数据库中发现IFIT3 mRNA在HNSC（鼻咽癌）中的表达量最高，而在PRAD（前列腺癌）中表达量最低。在Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)数据库中，肺部表达最高，骨骼表达最低。为了进一步分析，我们将TCGA和GTEx数据库合并，并使用非配对的Wilcoxon Rank Sum and Signed Rank Tests进行差异显著性分析。由于THYM，MESO，DLBC和UVM样本数量小于3个，IFIT3 mRNA表达差异无法统计。除了READ，SARC和UCEC以外，我们发现IFIT3 mRNA在18种肿瘤中显著上调，如BLCA，BRCA，CESC，CHOL，COAD，ESCA，GBM，HNSC，KIRC，LGG，LIHC，OV，PAAD，STAD，SKCM，THCA，TGCT和UCS。我们还观察到IFIT3 mRNA在8种肿瘤中显著下调，如LUAD，LUSC，KIRP，KICH，PRAD，PCPG，ACC和LAML。