使用python实现WKmeans算法
时间: 2023-11-18 21:42:26 浏览: 139
遗传算法python版
WKmeans算法是一种基于Kmeans的聚类算法,主要用于聚类数据集的子集。它通过最小化每个簇内部的方差来确定簇的数量和位置。在python中,我们可以使用scikit-learn库来实现WKmeans算法。以下是一个简单的实现:
```python
from sklearn.cluster import KMeans
def Wkmeans(X, kmax):
# 初始化变量
N = X.shape[0]
Wk = np.zeros(kmax)
D = np.square(pairwise_distances(X))
# 计算初始点
centers = []
centers.append(X.mean(axis=0))
# 计算Wk值
for k in range(2, kmax+1):
kmeans = KMeans(n_clusters=k, init=centers[-1]).fit(X)
centers.append(kmeans.cluster_centers_)
Dk = np.min(D[:,kmeans.labels_], axis=1)
Wk[k-1] = np.sum(Dk) / N
return Wk
```
在这个函数中,我们首先初始化了一些变量,包括数据集的大小N,以及聚类的最大数量kmax。我们还计算了数据集中每个点之间的欧几里得距离的平方,并将其存储在D变量中。
接下来,我们定义了一个centers列表,用于存储每个聚类的中心点。我们首先将第一个中心点设置为整个数据集的平均值。
然后,我们循环k从2到kmax,使用KMeans算法将数据集聚类为k个簇,并计算每个簇内的最小距离Dk。最后,我们将Wk值设置为所有簇的平均最小距离,并将其返回。
请注意,在实现WKmeans算法时,我们仅计算了簇内的方差,而不是Kmeans算法中使用的总方差。这是因为在WKmeans算法中,我们只关心簇内部的方差,而不关心簇之间的方差。
要使用此函数,您可以将数据集X和最大簇数kmax传递给Wkmeans函数,它将返回Wk值的数组。您可以使用这些Wk值来确定最佳的聚类数量。
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