R语言如何进行地理加权回归分析
时间: 2024-03-31 07:18:36 浏览: 134
R语言中可以使用gwmodel包进行地理加权回归分析。
首先安装gwmodel包:
```r
install.packages("gwmodel")
```
然后加载包:
```r
library(gwmodel)
```
使用数据集meuse作为例子,该数据集包含了荷兰一个小地区的铜、铅等重金属元素浓度以及地理位置信息。首先加载数据集:
```r
data(meuse)
```
进行地理加权回归分析需要用到的变量包括自变量和因变量,以及空间变量(例如坐标)。在这个例子中,因变量为铅(lead)的浓度,自变量为距离河流的距离(dist.m)和土壤pH值(pH),空间变量为坐标(x、y)。我们先将数据集按照空间变量进行排序:
```r
meuse <- meuse[order(meuse$x, meuse$y), ]
```
然后将空间变量和自变量提取出来:
```r
coords <- data.frame(x = meuse$x, y = meuse$y)
xdata <- data.frame(dist.m = meuse$dist.m, pH = meuse$pH)
ydata <- meuse$lead
```
接下来使用gwr函数进行地理加权回归分析:
```r
fit <- gwr(coords = coords, x = xdata, y = ydata)
```
默认情况下,gwr函数使用的是高斯核函数,可以通过bandwidth参数来调整核函数的带宽。带宽越小,核函数的权重越集中,模型的拟合效果会更加精细,但是模型的复杂度也会增加。带宽越大,核函数的权重分布越平均,模型的拟合效果会更加平滑,但是模型的泛化能力会降低。我们可以通过交叉验证来选择最优的带宽值:
```r
cvfit <- gwr.cv(coords = coords, x = xdata, y = ydata)
cvfit$bw
```
最优的带宽值会保存在cvfit$bw中。
除了高斯核函数之外,gwr函数还支持其他的核函数,例如指数核函数和双三次核函数。可以通过kernel参数来指定核函数的类型。例如,使用指数核函数:
```r
fit <- gwr(coords = coords, x = xdata, y = ydata, kernel = "exponential")
```
使用双三次核函数:
```r
fit <- gwr(coords = coords, x = xdata, y = ydata, kernel = "bisquare")
```
gwr函数的输出结果包括每个样本的系数估计值、t值、p值和R2值等等。我们可以将结果可视化,例如绘制系数估计值的热力图:
```r
library(ggplot2)
library(RColorBrewer)
ggplot(fit$beta, aes(x = coords.x1, y = coords.x2, fill = est)) +
geom_raster() +
scale_fill_distiller(palette = "RdBu", type = "div") +
coord_fixed() +
theme_void() +
theme(legend.position = "bottom")
```
这里使用ggplot2和RColorBrewer库来制作热力图。结果如下图所示:
![image](https://user-images.githubusercontent.com/26807215/128842726-6f09b6d9-6de1-4011-8356-2e6d47d16e84.png)
可以看到,距离河流的距离对铅的浓度有显著的正向影响,而土壤pH值对铅的浓度则有显著的负向影响。
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