circBase circRNA ID转换
时间: 2023-09-30 18:13:20 浏览: 473
在circBase中进行circRNA ID转换,可以按照以下步骤进行:
1. 打开circBase网站:http://www.circbase.org/
2. 点击页面右上角的“Search”按钮,在下拉菜单中选择“ID Conversion”。
3. 在“ID Conversion”页面中,选择“circRNA”作为输入ID类型,并输入您要转换的circRNA ID,如“hsa_circ_000001”。
4. 在“Output ID type”中选择您想要转换成的ID类型,如“Ensembl Gene ID”。
5. 点击“Convert”按钮,即可获得转换后的结果。
请注意,circBase中支持的ID类型较多,您可以根据您的具体需求选择适合您的ID类型。同时,如果您需要进行大规模的ID转换,circBase也提供了批量转换的功能。
相关问题
circBase 对应的circRNA
circBase数据库中收录了各种物种的circRNA数据,包括人类、小鼠、大鼠、斑马鱼、果蝇、线虫等等。目前circBase中收录的circRNA数量已经超过了40万个。这些circRNA具有多种功能,比如调节基因表达、参与细胞周期调节、参与免疫反应等等。circBase对这些circRNA进行了详细的注释和分类,并提供了丰富的分析工具和可视化界面,使研究人员可以更好地理解和研究circRNA的生物学功能和调控机制。
circRNA 的 circBase 名称
哦,我明白了,您是在询问 "circBase" 这个名称的来源和含义。circBase是一个数据库,专门收集和整理circRNA的相关信息和数据。其中 "circ" 代表循环,因为circRNA的分子结构是循环的。而 "Base" 则是指数据库,表示这是一个存储和管理circRNA数据的平台。circBase的建立旨在为研究人员提供方便的数据查询和分析工具,以进一步促进circRNA的研究和应用。
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