pymol linux安装

要在Linux上安装PyMOL，您可以按照以下步骤进行操作：

1. 首先，确保您已经安装了Python和pip包管理器。在终端中运行以下命令来检查它们的安装情况：

   python3 --version
   pip3 --version

2. 如果您尚未安装pip，请使用以下命令安装它：

   sudo apt-get install python3-pip

3. 安装PyMOL的依赖项。在终端中运行以下命令：

   sudo apt-get install build-essential libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev libglew-dev libpng-dev libfreetype6-dev python3-dev python3-numpy python3-pmw python3-qt5 python3-pyqt5.q

相关问题

pymol linux 脚本保存

要在Pymol中保存Linux脚本，首先需要将脚本编写为一个文本文件。可以使用任何文本编辑器（例如gedit、nano或vi）来创建并编辑该文件，确保将其保存为以".py"为后缀的Python脚本文件。

在脚本中，可以使用Pymol的Python API来指定所需的操作和参数。例如，可以导入Pymol模块、打开一个分子文件、应用显示选项、设置渲染样式等等。脚本的功能和内容完全由用户自行决定。

编写完脚本后，可以通过命令行运行Pymol并指定脚本文件的路径。假设脚本名为"script.py"，可以在终端中输入以下命令来运行脚本：

pymol -c script.py

这将在无窗口模式下运行Pymol，并执行脚本中定义的操作。

要将Pymol输出保存为文件，可以在脚本中使用Pymol的保存命令来指定输出文件的路径和格式。例如，使用以下命令将Pymol场景保存为图像文件：

cmd.png("output.png", width=800, height=600, dpi=300)

这将生成一个名为"output.png"的图像文件，宽度为800像素、高度为600像素，分辨率为300 dpi。

最后，可以使用Linux的文件管理器或命令行来访问和移动所保存的Pymol脚本和输出文件。可以通过直接在终端中输入文件路径来打开和编辑脚本文件，或者使用命令复制、移动或重命名文件。

linux安装pymol

### 回答1：
要在Linux上安装Pymol，请按照以下步骤操作：

1. 打开终端并输入以下命令以更新系统软件包：

sudo apt-get update

2. 安装Pymol所需的依赖项：

sudo apt-get install python-pmw python-pyqt4 python-opengl python-tk

3. 下载Pymol安装程序：

wget https://sourceforge.net/projects/pymol/files/latest/download

4. 解压缩下载的文件：

tar -xvf download

5. 进入解压后的目录：

cd pymol*

6. 运行安装程序：

sudo python setup.py install

7. 安装完成后，可以在终端中输入以下命令启动Pymol：

pymol

希望这可以帮助您安装Pymol。

### 回答2：
首先你需要下载并安装Python。Pymol 是在Python的特定版本上构建的，因此你需要使用支持 Pymol 的 Python 版本。建议选择Python 2.7 或 Python 3.5 并安装。

接下来，你需要从Pymol官方网站下载Pymol安装程序。在下载之前要确保下载正确的版本，因为 Pymol 有两个版本，分别是免费的开源版本和商业版本。

下载后，你需要在终端中执行以下命令来安装Pymol：

sudo apt-get update
sudo apt-get install pymol

这种方法应该适用于大多数Linux操作系统，包括Ubuntu和Debian。不过，如果你使用的是其他Linux发行版，可能会有所不同。在这种情况下，你可以尝试在终端中运行以下命令来安装Pymol：

sudo yum update
sudo yum install pymol

最后，完成安装后，你可以运行Pymol并开始使用它。只需在终端中键入以下命令：

pymol

这将启动Pymol图形用户界面（GUI），您可以通过该界面进行各种高级分子可视化和分析操作。准备好尝试了吗？

### 回答3：
pymol是一款常用于分子模拟和可视化的优秀软件，而Linux系统也是科学计算领域最为常用的操作系统之一。在这里，我们将介绍如何在Linux系统中安装pymol。

1.准备工作

在安装pymol之前，需要先确保您的Linux系统中已经安装了Python语言和OpenGL图形库，而且Python的版本需要大于等于2.7，同时Python的pip包管理工具也需安装。如果您的系统还没有安装Python和OpenGL，可以通过命令行执行以下命令来完成安装：

sudo apt-get install python-dev libgl1-mesa-dev

sudo apt-get install freeglut3 freeglut3-dev

sudo apt-get install python-pip

2.安装pymol

pymol的安装需要使用pip包管理工具，可以通过以下命令来安装：

sudo pip install pymol

安装过程中需要下载相关的依赖项，下载时间会有所不同，耐心等待即可。如果您的网络连接较慢，建议使用国内镜像站点进行安装。如果安装过程出现错误，可以尝试升级pip工具，并查看安装日志以获得更多信息。

3.运行pymol

pymol安装完成后，可以直接在命令行中输入pymol命令来运行pymol。也可以创建一个pymol的启动脚本，方便每次启动pymol时直接运行该脚本，避免频繁输入命令。

以上就是Linux系统中安装pymol需要的步骤，简单易行。pymol功能强大，运行稳定，是生物大分子计算研究的良好工具，帮助研究人员一窥生命大分子的神秘世界。