>>> for filename in os.listdir(gene_tree_folder): ... # 获取基因树文件路径 ... gene_tree_file = os.path.join(gene_tree_folder, filename) ... # 读取基因树文件 ... with open(gene_tree_file, 'r') as f: ... gene_tree = f.readlines() ... # 读取物种树文件 ... with open(species_tree_file, 'r') as f: ... species_tree = f.readlines() ... # 重排基因树分支顺序 ... reordered_gene_tree = reorder_gene_tree(gene_tree, species_tree) ... # 构造输出文件路径 ... output_file = os.path.join(output_folder, filename) ... # 将重排后的基因树保存到文件 ... with open(output_file, 'w') as f: ... f.writelines(reordered_gene_tree) ... print("基因树文件", filename, "重排完成,结 果已保存至", output_file) ... Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 11, in <module> File "<stdin>", line 6, in reorder_gene_tree TypeError: 'NoneType' object is not iterable
时间: 2024-04-12 08:34:04 浏览: 106
解决python中os.listdir()函数读取文件夹下文件的乱序和排序问题
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抱歉,出现了一个错误。看起来在 `reorder_gene_tree` 函数中出现了问题,导致返回了 `None` 值,而不是预期的基因树列表。
请确保在 `get_species_order` 函数中正确实现了获取物种树分支顺序的代码逻辑。如果你已经实现了该函数,请检查是否正确返回了物种树分支顺序的列表。
另外,请确保你使用的是正确的物种树文件路径。在每次循环中,应该使用对应的基因树文件和物种树文件。
如果你需要进一步的帮助,请提供 `get_species_order` 函数的代码片段,以便我可以更好地理解问题所在。
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