调库实现 DBSCAN 聚类 步骤 1:读入 PCA 降维后的二维鸢尾花数据集 步骤 2:调用 sklearn 库中 DBSCAN 类进行聚类(设 eps=0.5, min_samples=5), 得到簇的总数、各样本的所归属簇的编号。 步骤 3:调用 sklearn 库中函数,计算得到外部指标(RI、FMI,越大越好)和 内部指标(DBI,越小越好) 步骤 4:调用 matplotlib 的 scatter 函数将聚类后各样本可视化输出(不同簇内 的样本用不同的颜色表示)。
时间: 2024-03-18 21:41:56 浏览: 179
好的,这是一个关于实现 DBSCAN 聚类的流程。下面是具体的实现步骤:
步骤 1:读入 PCA 降维后的二维鸢尾花数据集
首先,需要读入 PCA 降维后的二维鸢尾花数据集。可以使用 Pandas 库中的 read_csv 函数来读取数据集,并将其存储为 DataFrame 类型。例如:
```
import pandas as pd
# 读取数据集
data = pd.read_csv('iris_pca.csv')
```
步骤 2:调用 sklearn 库中 DBSCAN 类进行聚类
接下来,可以使用 sklearn 库中的 DBSCAN 类进行聚类。需要设置 eps 和 min_samples 两个参数。eps 是指样本之间的最大距离,min_samples 是指一个簇中最少需要包含的样本数。例如:
```
from sklearn.cluster import DBSCAN
# 调用 DBSCAN 类进行聚类
dbscan = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=5)
dbscan.fit(data)
# 获取簇的总数和各样本的所属簇的编号
labels = dbscan.labels_
n_clusters = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
```
步骤 3:计算外部指标和内部指标
聚类完成后,可以使用 sklearn 库中的函数计算外部指标和内部指标。RI 和 FMI 越大越好,DBI 越小越好。例如:
```
from sklearn.metrics import adjusted_rand_score, fowlkes_mallows_score, davies_bouldin_score
# 计算外部指标(RI、FMI)
ri = adjusted_rand_score(labels_true, labels) # labels_true 是真实的标签
fmi = fowlkes_mallows_score(labels_true, labels)
# 计算内部指标(DBI)
dbi = davies_bouldin_score(data, labels)
```
步骤 4:可视化输出
最后,可以使用 matplotlib 库的 scatter 函数将聚类后的各样本可视化输出。不同簇内的样本可以使用不同的颜色表示。例如:
```
import matplotlib.pyplot as plt
# 将聚类结果可视化输出
plt.scatter(x=data['x'], y=data['y'], c=labels)
plt.show()
```
这就是实现 DBSCAN 聚类的完整流程。
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