对于allen脑图谱的代码

对于 Allen 脑图谱的代码，需要先下载相关的数据集和 MATLAB 工具箱，然后可以使用 MATLAB 对数据进行分析和可视化。

1. 下载数据集

可以从 Allen 脑图谱网站（https://portal.brain-map.org/）下载相关数据集，包括脑区轮廓、基因表达数据等。

2. 安装 MATLAB 工具箱

可以从 Allen 脑图谱网站下载相关 MATLAB 工具箱，包括 `allenCCF`、`allenInstituteAtlas`、`allenSDK` 等。

3. 加载数据

% 加载脑区轮廓数据
load('annotation_25.mat');
% 加载基因表达数据
load('ISH_data_set.mat');

4. 数据分析

可以对基因表达数据进行聚类、差异分析等。

% 对基因表达数据进行聚类
clustergram(ISH_data_set);
% 对基因表达数据进行差异分析
[~, ~, stats] = anova1(ISH_data_set);
multcompare(stats);

5. 数据可视化

可以对脑区轮廓进行可视化，根据基因表达数据进行着色等。

% 可视化脑区轮廓
allenCCF.plotBrainGrid(annotation); 
% 根据基因表达数据进行着色
allenSDK.plotStructureData(annotation, ISH_data_set(:,gene_id));

以上仅是部分代码示例，具体代码还需根据实际情况进行编写。