cellmarker包如何使用

cellmarker是一个用于细胞类型标记的R包，可以通过以下步骤使用：

1. 安装cellmarker包。

install.packages("cellmarker")

2. 导入所需的数据。

cellmarker包的数据需要下载并导入到R中，可以通过以下命令下载并导入数据：

library(cellmarker)
data(cell_markers)

3. 运行cellmarker函数。

通过调用cellmarker函数来进行细胞类型标记，例如：

cell.type <- cellmarker(data, gene.list = cell_markers$gene.list, species = "human")

其中，data是输入的基因表达数据，gene.list是cellmarker包提供的基因列表，species是指定物种。

4. 查看标记结果。

标记结果存储在cell.type变量中，可以通过table函数来查看各个细胞类型的数量：

table(cell.type)

相关问题

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