以R中自带的ChicagoNMMAPS数据集为例(该数据集包含1987-2000年芝加哥每日的死亡率、天气(温度、露点温度、相对湿度)和污染(PM10和臭氧)等情况),如何以此数据集建立广义相加模型GAMs?其中温度为自变量,死亡率为因变量,其他因素设为混杂因素进行控制。请详细解答
时间: 2024-01-23 14:02:11 浏览: 204
首先需要安装mgcv包,该包是R中用于GAMs建模的常用包。
```R
install.packages("mgcv")
```
然后导入数据集:
```R
data(ChicagoNMMAPS)
```
接下来,我们需要对数据集进行预处理,包括筛选变量、处理缺失值等。为了简化问题,我们只选取温度和死亡率两个变量进行建模,同时删除缺失值。
```R
# 筛选变量并删除缺失值
data <- na.omit(ChicagoNMMAPS[, c("temp", "death")])
```
然后,我们可以使用`gam()`函数建立GAMs模型。在该模型中,我们将温度作为自变量,死亡率作为因变量,并控制其他因素(相对湿度、露点温度、PM10和臭氧)。
```R
library(mgcv)
# 建立GAMs模型
model <- gam(death ~ s(temp) + s(hum) + s(dewp) + s(pm10) + s(ozone), data = data)
```
其中,`s()`函数表示进行光滑函数拟合,将控制变量进行光滑处理。
最后,我们可以使用`summary()`函数查看模型的结果。
```R
summary(model)
```
通过模型结果,我们可以了解到温度对死亡率的影响关系,并得到其他控制变量的影响程度。
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R中自带的ChicagoNMMAPS数据集为例,如何建立gam 模型,请提供详细代码
ChicagoNMMAPS数据集包含了2001年至2005年芝加哥市区的空气污染数据,可以用于建立空气污染预测模型。下面是建立广义相加模型的R代码,其中包含了数据的导入、数据预处理和模型拟合等步骤:
```
# 导入数据
data(ChicagoNMMAPS)
# 查看数据
head(ChicagoNMMAPS)
# 对pm25进行对数变换
ChicagoNMMAPS$log_pm25 <- log(ChicagoNMMAPS$pm25)
# 建立广义相加模型
library(mgcv)
model <- gam(log_pm25 ~ s(time) + s(temperature) + s(wind_speed) + s(humidity), data=ChicagoNMMAPS, family=gaussian())
# 查看模型拟合结果
summary(model)
```
上述代码中,首先使用data()函数导入ChicagoNMMAPS数据集,然后使用head()函数查看数据。接着,对pm25变量进行对数变换,以使其更符合正态分布的假设。最后,使用gam()函数建立广义相加模型,其中响应变量为log_pm25(对数变换后的pm25),预测变量包括时间、温度、风速和湿度,使用高斯分布的family参数指定响应变量的分布类型。
使用summary()函数可以查看模型的拟合结果,包括每个变量的平滑项的平滑系数、拟合优度等等。
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