某个目录下有bin目录，data目录，include目录，lib目录，src目录，CMakeLists.txt文件，这时候该怎么运行src目录下的.cpp文件

您需要先进入src目录，然后编译该.cpp文件生成可执行文件，最后运行该可执行文件。具体步骤如下：

1. 打开终端，进入该目录：

cd /path/to/the/directory

2. 进入src目录：

cd src

3. 编译.cpp文件，生成可执行文件，假设该.cpp文件名为main.cpp：

g++ -o main main.cpp

4. 运行可执行文件：

./main

这样就可以在终端中运行src目录下的.cpp文件了。请注意，上述命令中的路径和文件名需要根据实际情况进行修改。