具体算法过程如下: 计算多变量之间的MIC矩阵; 挑选出相关系数最高的一对变量A和B; 分别对A和B计算其与其它变量相关系数的平均值α ,β ; 如果α >β,删除变量A,否则删除B。 重复2-4步直到所有变量两两之间的相关系数低于给定阈值。 根据以上流程写python代码
时间: 2024-03-27 09:38:36 浏览: 132
以下是一个基于MIC算法的特征选择Python实现示例:
```python
import numpy as np
import pandas as pd
import minepy
def calc_MI(x, y, bins):
m = minepy.MINE()
m.compute_score(x, y)
return m.mic()
def MIC_selection(data, threshold):
n_features = data.shape[1]
MIC_matrix = np.zeros((n_features, n_features))
for i in range(n_features):
for j in range(i+1, n_features):
MIC_matrix[i,j] = calc_MI(data.iloc[:,i], data.iloc[:,j], bins=10)
MIC_matrix[j,i] = MIC_matrix[i,j]
selected_features = set(range(n_features))
while len(selected_features) > 0:
best_candidate = None
max_MIC = -1
for candidate in selected_features:
MIC_with_all = [MIC_matrix[candidate, other] for other in selected_features if other != candidate]
avg_MIC = np.mean(MIC_with_all)
if avg_MIC > max_MIC:
max_MIC = avg_MIC
best_candidate = candidate
if max_MIC < threshold:
break
selected_features.remove(best_candidate)
MIC_matrix = MIC_matrix[np.array(list(selected_features)),:][:,np.array(list(selected_features))]
return data.iloc[:, list(selected_features)]
```
其中,`calc_MI` 函数用于计算两个变量之间的MIC系数,`MIC_selection` 函数实现了基于MIC算法的特征选择过程。输入参数 `data` 是一个 pandas DataFrame 类型的数据集,`threshold` 是给定的相关系数阈值,可以通过调整该值来控制特征选择的严格程度。输出结果是一个 pandas DataFrame 类型,包含了被选择的特征列。
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