isomap降维算法matlab

以下是使用MATLAB实现ISOMAP降维算法的示例代码：

1. 导入数据

首先，我们需要导入需要降维的数据。这里我们使用MATLAB自带的鸢尾花数据集。

load fisheriris

2. 计算距离矩阵

接下来，我们需要计算原始数据的距离矩阵。这里我们使用欧几里得距离。

D = pdist(meas);

3. 执行ISOMAP算法

现在，我们可以执行ISOMAP算法了。这里我们使用MATLAB的函数isomap。

Y = isomap(D, 2);

这里的参数2表示我们想要将数据降至2维。

4. 可视化降维结果

最后，我们可以将降维后的结果可视化。

scatter(Y(:,1), Y(:,2), 15, species, 'filled');
xlabel('Component 1');
ylabel('Component 2');
title('ISOMAP Embedding');

这里的scatter函数用于绘制散点图。Y(:,1)和Y(:,2)分别表示降维后的第一维和第二维。第三个参数表示散点的大小，第四个参数表示不同类别的散点使用不同的颜色填充。最后两行代码用于添加坐标轴标签和标题。

完整代码如下：

load fisheriris
D = pdist(meas);
Y = isomap(D, 2);
scatter(Y(:,1), Y(:,2), 15, species, 'filled');
xlabel('Component 1');
ylabel('Component 2');
title('ISOMAP Embedding');