metrics <- confusionMatrix(predictions, data$Y) Error: `data` and `reference` should be factors with the same levels.

这个错误通常表示数据中的预测值和实际值没有匹配或不一致。你可以尝试检查以下几个方面来解决这个问题：

1. 确保你的预测结果和实际值都是因子类型。
2. 检查你的预测结果和实际值的水平是否完全匹配。
3. 检查是否有缺失值或异常值导致了数据不匹配。
4. 尝试重新拟合模型或者使用其他模型进行预测。

希望这些提示能帮助你解决这个问题。