ubuntu中docker安装GATK
时间: 2024-06-19 09:04:49 浏览: 185
在Ubuntu系统中,可以通过以下步骤安装Docker和GATK:
1. 首先,安装Docker。可以使用以下命令在Ubuntu上安装Docker:
```
sudo apt-get update
sudo apt-get install docker.io
```
2. 然后,使用Docker安装GATK。可以使用以下命令在Docker中安装GATK:
```
sudo docker pull broadinstitute/gatk
```
3. 运行GATK容器。可以使用以下命令启动GATK容器:
```
sudo docker run -it broadinstitute/gatk
```
运行该命令后,您将进入容器的交互式终端中。现在您可以在容器中运行GATK并进行分析。
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