一个四列数据的df,索引为date,如何用numpy算sperman相关系数,再用plotly展示相关系数矩阵
时间: 2024-09-26 09:16:40 浏览: 37
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首先,为了在NumPy中计算Spearman秩相关系数,你需要将DataFrame转换为NumPy数组。假设有这样一个DataFrame `df`,索引是日期 (`date`),有四个列 (`col1`, `col2`, `col3`, `col4`),我们可以按照以下步骤操作:
1. 将DataFrame转换为NumPy数组:
```python
data = df.values
```
这会提取出数据部分并忽略索引(因为我们只关心数值内容)。
2. 使用`scipy.stats.spearmanr()`计算相关系数矩阵:
```python
from scipy.stats import spearmanr
# 确保行对应列,而不是列对应行(即把axis设置为0)
correlation_matrix = spearmanr(data.T, axis=0).correlation
```
`data.T` 表示转置,因为我们通常希望行代表观测,而列代表变量。
3. 为了可视化相关系数矩阵,我们将使用Plotly库。首先,需要安装 Plotly:
```bash
pip install plotly
```
然后创建一个热力图(heatmap):
```python
import plotly.express as px
fig = px.imshow(correlation_matrix, x=df.columns, y=df.columns, color_continuous_scale='RdBu_r', center=0)
fig.update_layout(title="Spearman Rank Correlation Matrix", xaxis_title="Columns", yaxis_title="Columns")
fig.show()
```
这个热力图会显示一个颜色编码的相关系数矩阵,深色表示高度正相关,浅色表示负相关或接近零。
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