脚本获取PDB数据库指定关键词的蛋白质文件，保留“SEQADV”开头的行中以关键字“ENGINEERED MUTATION”指示的突变蛋白结构

脚本编写用于从PDB数据库检索特定关键词（如“ENGINEERED MUTATION”）的蛋白质文件，通常需要使用生物信息学工具和PDB API。一种常见的Python库是`pdbpy`，它简化了与PDB的交互。以下是一个简单的示例，说明如何使用`pdbpy`获取相关信息：

import pdbpy

# 定义关键词
keyword = "ENGINEERED MUTATION"

# 连接到PDB数据库
pdb = pdbpy.Pdb()

# 搜索包含关键词的序列注释（SEQADV）
matches = [entry for entry in pdb if 'SEQADV' in entry.description and keyword in entry.description]

# 遍历匹配结果并保存文件
for match in matches:
    # 获取pdb ID
    pdb_id = match.entry_id
    # 下载pdb文件
    structure = pdb.get_structure(pdb_id)
    # 可能需要将结构转换成适当的格式（如PDB、FASTA等），这里假设已经存在适当函数
    save_function(structure, f"{pdb_id}_{keyword}.pdb")