R语言计算多样性指数

在R语言中，可以使用"vegan"包来计算多样性指数。下面是一个示例代码，用于计算样本的Shannon多样性指数：

# 安装和加载vegan包
install.packages("vegan")
library(vegan)

# 创建一个样本矩阵
# 每一列代表一个物种，每一行代表一个样本
sample_matrix <- matrix(c(10, 20, 0, 5, 15, 2, 8, 12, 3), ncol = 3, byrow = TRUE)

# 计算Shannon多样性指数
shannon_index <- diversity(sample_matrix, index = "shannon")

# 输出结果
print(shannon_index)

输出结果将是Shannon多样性指数的值。