我要打印成2d的结构式
时间: 2023-10-20 19:05:37 浏览: 108
结构体打印器
如果你想将SDF文件中的分子结构以2D结构式的形式打印出来,你可以使用RDKit库的`Draw`模块。以下是一个示例代码:
```python
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
def save_structure_images(filename, output_folder):
suppl = Chem.SDMolSupplier(filename)
for i, mol in enumerate(suppl):
if mol is not None:
output_file = f"{output_folder}/structure_{i+1}.png"
img = Draw.MolToImage(mol, size=(300, 300))
img.save(output_file)
# 调用函数保存SDF文件中的分子结构图片
save_structure_images("your_file.sdf", "D:/streptomedb")
```
请将代码中的`your_file.sdf`替换为你要处理的SDF文件的路径,`D:/streptomedb`为你希望保存图片的文件夹路径。该代码使用RDKit库读取SDF文件,并将每个分子的2D结构以图片形式保存到指定文件夹中。注意确保D盘下的streptomedb文件夹存在。你可以通过调整`size`参数来设置图片的大小。
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