我已经得到了电极的名称,也有了连接矩阵,电极位置信息是10-20标准电极布局,接下里如何用mne怎么画脑功能连接图
时间: 2024-04-08 21:29:26 浏览: 265
您可以使用MNE库中的`mne.connectivity.spectral_connectivity`函数来计算脑功能连接,并使用`mne.viz.plot_connectivity_circle`函数绘制连接图。
首先,您需要导入所需的库和加载数据。假设您已经加载了原始数据,并且有一个名为`epochs`的`mne.Epochs`对象。
```python
import numpy as np
import mne
from mne.connectivity import spectral_connectivity
from mne.viz import plot_connectivity_circle
# 设置matplotlib以交互模式显示图形(如果需要)
# %matplotlib auto
# 提取数据
data = epochs.get_data()
# 获取电极名称
ch_names = epochs.ch_names
# 获取采样频率
sfreq = epochs.info['sfreq']
```
接下来,您可以使用`spectral_connectivity`函数计算脑功能连接。这个函数将返回连接矩阵和频谱信息。
```python
# 计算脑功能连接
con, freqs, times, n_epochs, n_tapers = spectral_connectivity(
data, method='pli', mode='multitaper', sfreq=sfreq,
fmin=1, fmax=40, faverage=True, n_jobs=1)
```
在这个例子中,我们使用了相位锁定指数(PLI)作为连接度量,多窗口平均的方式进行计算。您可以根据自己的需求选择不同的方法和参数。
最后,您可以使用`plot_connectivity_circle`函数绘制连接图。
```python
# 绘制连接图
plot_connectivity_circle(con, ch_names, n_lines=300,
node_colors='white', title='Functional Connectivity')
```
这将绘制一个连接图,其中节点代表电极,边表示连接强度。
请注意,如果您使用Jupyter Notebook或类似的环境,您可能需要取消注释`%matplotlib auto`这一行,以便在绘图后自动显示图形。
希望这可以帮助您使用MNE库来绘制脑功能连接图!
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