使用python,将3D的nii.gz图片转换成2D的.jpg格式图片

时间: 2023-04-04 19:00:25 浏览: 110
你好,我可以回答这个问题。您可以使用Python中的SimpleITK库来读取nii.gz格式的3D图像,并使用PIL库将其转换为2D的.jpg格式图片。以下是示例代码: ```python import SimpleITK as sitk from PIL import Image # 读取nii.gz格式的3D图像 image = sitk.ReadImage('path/to/your/image.nii.gz') # 将3D图像转换为2D图像 slice = sitk.GetArrayFromImage(image)[,:,:] # 取第一张切片 slice = slice.astype('uint8') # 转换数据类型 img = Image.fromarray(slice) # 转换为PIL Image对象 # 保存为.jpg格式图片 img.save('path/to/your/image.jpg') ``` 希望能对您有所帮助!
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python 批量修改nii.gz格式图像分辨率

可以使用 SimpleITK 库来批量修改 nii.gz 格式图像的分辨率。以下是一个示例代码: ```python import SimpleITK as sitk import os input_dir = "/path/to/input/dir" output_dir = "/path/to/output/dir" new_spacing = (1.0, 1.0, 1.0) # 新的分辨率 for filename in os.listdir(input_dir): if filename.endswith(".nii.gz"): input_path = os.path.join(input_dir, filename) output_path = os.path.join(output_dir, filename) image = sitk.ReadImage(input_path) old_spacing = image.GetSpacing() new_size = [int(round(old_size * old_spacing / new_spacing)) for old_size in image.GetSize()] resample = sitk.ResampleImageFilter() resample.SetOutputSpacing(new_spacing) resample.SetSize(new_size) resample.SetOutputDirection(image.GetDirection()) resample.SetOutputOrigin(image.GetOrigin()) resample.SetTransform(sitk.Transform()) resample.SetInterpolator(sitk.sitkLinear) resampled_image = resample.Execute(image) sitk.WriteImage(resampled_image, output_path) ``` 这个代码会将 `input_dir` 目录下所有的 `.nii.gz` 文件的分辨率修改为 `(1.0, 1.0, 1.0)`,并保存到 `output_dir` 目录下。

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