complexheatmap代码
时间: 2023-10-10 17:12:37 浏览: 69
ComplexHeatmap 是一个基于 R 语言的绘制高级热图的软件包,可以用于多种数据类型的可视化。它提供了灵活的参数设置和自定义功能,使用户可以轻松地创建自己所需的高级热图。
以下是一个简单的 ComplexHeatmap 示例:
```R
library(ComplexHeatmap)
# 创建一个示例数据集
mat = matrix(rnorm(100), nrow = 10)
# 创建颜色映射
col_fun = colorRamp2(c(-2, 0, 2), c("blue", "white", "red"))
# 创建行和列标签
row_names = paste0("Row", 1:10)
col_names = paste0("Col", 1:10)
# 创建一个 Heatmap 对象并绘制
Heatmap(mat, name = "Example", col = col_fun, row_names_side = "left",
row_names_gp = gpar(fontsize = 8), column_names = col_names,
column_names_side = "bottom", column_names_gp = gpar(fontsize = 8))
```
该示例将创建一个 10x10 的随机矩阵,并使用 `colorRamp2()` 函数创建一个颜色映射。然后,使用 `Heatmap()` 函数创建一个 Heatmap 对象,并指定行和列标签、颜色映射等参数。最后,使用 `draw()` 函数将 Heatmap 对象绘制出来。
除了以上示例,ComplexHeatmap 还提供了许多其他功能和参数设置,可以根据具体需求进行调整和定制。更多详细信息和示例,请参考官方文档:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/
阅读全文