nii.gz格式的医学影像图片如何输入模型进行训练

时间: 2023-02-09 13:05:03 浏览: 127
nii.gz格式的医学影像图片需要先进行解压缩,然后使用相应的库进行读取。在深度学习中常用的库有nibabel和SimpleITK。读取之后,对数据进行预处理,例如归一化,裁剪等操作。最后将预处理后的数据输入模型进行训练。
相关问题

python实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据

可以使用Python中的nibabel库来读取和写入nii.gz格式的数据,使用numpy库进行数组操作。 首先,需要安装nibabel库和numpy库: ``` pip install nibabel pip install numpy ``` 接下来,可以按照以下步骤来实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据: 1. 导入nibabel库和numpy库: ``` import nibabel as nib import numpy as np ``` 2. 使用nibabel库的load函数来读取T1和T1ce模态数据: ``` t1_img = nib.load('t1.nii.gz') t1ce_img = nib.load('t1ce.nii.gz') ``` 3. 使用nibabel库的get_fdata函数将nii.gz格式的数据转换为numpy数组: ``` t1_data = t1_img.get_fdata() t1ce_data = t1ce_img.get_fdata() ``` 4. 对T1和T1ce模态数据的numpy数组进行做差操作得到sub: ``` sub_data = t1_data - t1ce_data ``` 5. 使用nibabel库的Nifti1Image函数将sub的numpy数组转换为nii.gz格式的数据: ``` sub_img = nib.Nifti1Image(sub_data, t1_img.affine) ``` 6. 使用nibabel库的save函数将sub的nii.gz格式数据保存到文件: ``` nib.save(sub_img, 'sub.nii.gz') ``` 通过以上步骤,就可以实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据。

python 修改nii.gz格式图像分辨率

可以使用 nibabel 库来读取和修改 nii.gz 格式的图像分辨率。具体的代码如下: ```python import nibabel as nib # 读取 nii.gz 格式的图像 img = nib.load('example.nii.gz') # 获取图像的头信息 header = img.header.copy() # 修改分辨率 header['pixdim'][1:4] = [1.0, 1.0, 1.0] # 保存修改后的图像 nib.save(img.get_fdata(), 'example_new.nii.gz', header=header) ``` 这段代码将 nii.gz 格式的图像的分辨率修改为 1x1x1。

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