在Linux系统中如何安装Velvet工具，并配置其进行de Bruijn图组装的步骤是怎样的？请详细说明编译、运行以及高级参数设置。

为了在Linux系统中安装并配置Velvet工具进行基因组序列的de Bruijn图组装，用户可以参考《Velvet工具指南：安装与运行详解》这份详尽的指南。首先，安装前确保系统满足硬件和软件环境要求，例如足够的内存和硬盘空间。接着，根据系统环境选择合适的编译选项进行编译。例如，可以使用命令‘make clean; make velvetg MAXKMERLENGTH=25 COV_CUTOFF=10’进行编译，其中MAXKMERLENGTH和COV_CUTOFF是根据序列数据进行调整的参数。编译完成后，使用velveth命令创建de Bruijn图，如‘velveth velvet_out/ 21 -fastq.gz -shortPaired -separate’，其中‘velvet_out/’是输出目录，‘21’指定了k-mer的大小。然后，运行velvetg命令来优化图并生成contigs，例如‘velvetg velvet_out/ -exp_length 150’，其中‘-exp_length’参数用来指定期望的读取长度。对于高级用户，可以探索如TourBus、RockBand等高级参数来进一步调整组装过程。在处理输出文件时，需要注意contigs.fa、stats.txt、velvetasm.afg和LastGraph等文件的格式和使用。对于实际使用中可能遇到的问题，指南中也提供了性能优化和错误处理的建议。通过这份指南，即使是初学者也能够掌握Velvet的安装和运行，而经验丰富的生物信息学家可以深入了解高级配置和问题解决策略。

参考资源链接：[Velvet工具指南：安装与运行详解](https://wenku.csdn.net/doc/1uao4uuo00?spm=1055.2569.3001.10343)