可以整合以上完整代码吗
时间: 2024-09-15 13:13:02 浏览: 47
当然可以。这里是一个整合后的完整代码段,包括冠状面图像的处理:
```python
import pydicom
import numpy as np
import SimpleITK as sitk
import scipy.ndimage
import matplotlib.pyplot as plt
# 定义辅助函数
def load_dicom_folder(folder_path):
dicom_series = sitk.ImageSeriesReader_GetGDCMSeriesFileNames(folder_path)
reader = sitk.ImageSeriesReader()
reader.SetFileNames(dicom_series)
image = reader.Execute()
return image
def compute_coronal_drr(image, angle):
if image.ndim == 3: # 如果有三维数据(考虑深度)
angle = -angle # 因为需要沿着Z轴旋转,所以角度取负值
projection = scipy.ndimage.rotate(image, angle, axes=(2, 1), reshape=False)
else:
raise ValueError("Input image is not 3-dimensional for a coronal view.")
return np.max(projection, axis=0) # 保持二维图像
# 主函数
def main(dicom_folder_path, angles):
# 读取DICOM数据
dcm_image = load_dicom_folder(dicom_folder_path)
dcm_data = sitk.GetArrayFromImage(dcm_image) # 转换成numpy数组
# 生成不同角度的冠状面DRR图像
for angle in angles:
drr_image = compute_coronal_drr(dcm_data, angle)
fig, ax = plt.subplots()
ax.imshow(drr_image, cmap='gray')
ax.set_title(f'Coronal DRR Image at {angle} degrees')
ax.set_xlabel('Column') # 更新x轴标签
ax.set_ylabel('Row') # 更新y轴标签
plt.savefig(f'coronal_drr_image_{angle}.png')
plt.show()
# 设置路径和角度
dicom_folder_path = 'your_dicom_folder_path' # 替换为您的DICOM文件夹路径
angles = [0, 45, 90] # 示例角度
# 执行主函数
main(dicom_folder_path, angles)
```
这个版本的代码不仅包含冠状面图像的计算,还包含了创建新图窗口并保存图像的步骤。请确保将`your_dicom_folder_path`替换为你实际的DICOM文件夹路径。运行此代码后,将会生成一系列冠状面的DRR图像,并保存为指定的文件名。
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