Adding missing grouping variables: `gene_name`
时间: 2024-01-06 19:05:32 浏览: 190
当使用`dplyr`包中的函数进行数据处理时,如果数据框中有分组变量(例如`gene_name`列),则需要在每个操作中指定分组变量,以确保正确地对每个分组进行处理。如果在某些操作中忘记指定分组变量,则会出现“Adding missing grouping variables”的警告信息。
这个警告信息表示,`dplyr`在执行某个操作时,发现某些分组变量(例如`gene_name`)在当前数据框中不存在,因此它会自动添加这些变量作为分组变量,并继续进行操作。这可能会导致一些问题,因为它可能会增加额外的计算负担或导致结果不准确。
为了避免这个警告信息,应该在每个操作中明确指定分组变量。例如,在使用`mutate()`函数进行计算时,应该明确指定`gene_name`列作为分组变量,如下所示:
```
d %>%
group_by(gene_name) %>%
mutate(row_mean = rowMeans(select(., -gene_name)), .groups = "drop") %>%
slice(which.max(row_mean)) %>%
select(-row_mean)
```
其中,`.groups = "drop"`用于避免在输出中添加分组信息。这样可以确保在`mutate()`函数中使用`rowMeans()`函数时,会对每个分组的数据进行计算,而不会出现“Adding missing grouping variables”的警告信息。
相关问题
d %>% + group_by(gene_name) %>% + mutate(row_mean = rowMeans(select(., -gene_name)), .groups = "drop") %>% + slice(which.max(row_mean)) %>% + select(-row_mean) Adding missing grouping variables: `gene_name`
这段代码中,使用了`+`符号来将多行代码连接在一起,不过在每行代码结尾处都加上了`+`符号,应该去掉这些多余的符号。
另外,出现“Adding missing grouping variables: `gene_name`”警告信息的原因是,在`mutate()`函数中没有明确指定`gene_name`列作为分组变量。需要将`mutate()`函数中的`select(., -gene_name)`改为`select(., -gene_name) %>% ungroup()`,以去除分组信息并确保`rowMeans()`函数对整个数据框进行计算。修改后的代码如下:
```
d %>%
group_by(gene_name) %>%
mutate(row_mean = rowMeans(select(., -gene_name) %>% ungroup()), .groups = "drop") %>%
slice(which.max(row_mean)) %>%
select(-row_mean)
```
这样就可以避免警告信息的出现,并正确地对每个分组进行计算。
d %>% + group_by(gene_name) %>% + mutate(row_mean = rowMeans(select(., -gene_name) %>% ungroup()), .groups = "drop") %>% + slice(which.max(row_mean)) %>% + select(-row_mean) Adding missing grouping variables: `gene_name`
这段代码中,使用了`+`符号来将多行代码连接在一起,不过在每行代码结尾处都加上了`+`符号,应该去掉这些多余的符号。
另外,出现“Adding missing grouping variables: `gene_name`”警告信息的原因是,在`mutate()`函数中没有明确指定`gene_name`列作为分组变量。需要将`mutate()`函数中的`select(., -gene_name)`改为`select(-gene_name) %>% ungroup()`,以去除分组信息并确保`rowMeans()`函数对整个数据框进行计算。修改后的代码如下:
```
d %>%
group_by(gene_name) %>%
mutate(row_mean = rowMeans(select(-gene_name) %>% ungroup()), .groups = "drop") %>%
slice(which.max(row_mean)) %>%
select(-row_mean)
```
这样就可以避免警告信息的出现,并正确地对每个分组进行计算。
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