如何在Ubuntu系统上通过自定义编译安装并启用GPU加速功能的LAMMPS？

在Ubuntu系统上通过自定义编译安装LAMMPS并启用GPU加速功能，是提高分子动力学模拟效率的有效途径。为了确保你能够顺利地完成这个过程，强烈推荐你参考这份资料：《LAMMPS安装指南：含GPU编译与案例》。这份指南详细介绍了从源码编译到GPU加速配置的全部步骤，并提供了丰富的案例。

参考资源链接：[LAMMPS安装指南：含GPU编译与案例](https://wenku.csdn.net/doc/7pbx29o2cc?spm=1055.2569.3001.10343)

首先，确保系统已经安装了必要的编译工具和依赖库。可以使用以下命令安装这些基础工具：

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install libfftw3-dev
sudo apt-get install libopenmpi-dev

接着，下载LAMMPS的最新源码包，并解压到本地目录。然后，在源码目录中，执行以下命令来启用GPU加速以及其他的计算包：

cd lammps
make yes-cuda
make yes-manybody
make yes-molecule
# 其他需要的包可以通过类似命令添加

之后，配置Makefile以使用GPU和FFT库：

export FFTW3_LIB=

参考资源链接：[LAMMPS安装指南：含GPU编译与案例](https://wenku.csdn.net/doc/7pbx29o2cc?spm=1055.2569.3001.10343)