层次聚类特征分析python
时间: 2024-08-25 13:01:19 浏览: 46
Python实现简单层次聚类算法以及可视化
层次聚类是一种无监督学习方法,用于将数据集中的样本分组成层次结构的类别。Python中可以使用scikit-learn库中的`AgglomerativeClustering`模块来进行层次聚类。它的基本步骤包括:
1. **计算距离**:首先,需要对数据点之间的相似度或距离进行测量,常用的距离度量有欧氏距离、曼哈顿距离等。
2. **初始化**:选择一个合适的连接准则(如单链接、全连接、平均链接或 Ward 聚合),开始将最相似的数据点组合成簇。
3. **合并簇**:不断合并最近邻的簇,直到达到预定的簇数或者满足其他终止条件,比如簇间的差异不再显著。
4. **形成层次树**:整个过程会生成一个称为 dendrogram 的层次图,展示每个阶段的聚类情况。
5. **可视化**:对于大型数据集,可以使用`seaborn`或`plotly`等库将层次聚类结果可视化。
示例代码如下:
```python
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
import matplotlib.pyplot as plt
# 假设 X 是数据矩阵
cluster = AgglomerativeClustering(n_clusters=3)
labels = cluster.fit_predict(X)
# 可视化层次聚类结果
dendrogram = ward_tree = cluster.dendrogram_
plt.show()
```
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