pymatgen模块

`pymatgen` 是一个强大的 Python 软件包，专门针对材料科学研究设计，提供了对化合物的结构分析（如从头构建晶体结构）、电子结构计算、热力学和动力学等方面的功能支持。它允许用户轻松地进行诸如晶体化学筛选、计算新材料性质以及模拟材料生长过程等工作[^1]。

为了演示使用`pymatgen`建立一个立方晶格的简单示例[^2]：

import pymatgen as mg
from pymatgen.core import Lattice, Structure

# 使用Pymatgen的Lattice类定义一个立方晶格，以晶格常数为参数
lattice_parameters = [4.2, 4.2, 4.2, 90, 90, 90]
lattice = Lattice.cubic(a=lattice_parameters[0])  # 单位长度是angstroms 默认

# 创建Structure实例，指定原子种类和位置
structure_example = Structure(lattice, ["Na", "Cl"], [[0, 0, 0], [0.5, 0.5, 0.5]], coords_are_cartesian=True)

# 访问并打印晶格参数
print(structure_example.lattice.matrix)

这段代码会输出一个3x3表示晶格矩阵，反映立方晶格的周期性和对应晶格向量。在这个例子中，“Na”和“Cl”代表钠和氯原子，而[[0, 0, 0], [0.5, 0.5, 0.5]]给出了每个离子在三维空间的位置。

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