在python终端中seq = "AUGGCUAAGUCC" s, mfe = RNA.fold(seq) print(s) print(mfe)输出结果为0
时间: 2024-03-08 10:47:45 浏览: 35
Python库 | seq_uuid-1.0.1-py3.9.egg
如果在Python终端中运行ViennaRNA的Python库时,输出的二级结构和最小自由能都为0,可能是因为你的序列长度不足以形成稳定的二级结构或序列中有错误的字符导致预测失败。
你可以尝试输入一个长度更长的序列来进行预测,例如:
```python
seq = "AUGGCUAAGUCCUGACUGACUGACUACGUACGUACGUACGUACGUACGUACG"
s, mfe = RNA.fold(seq)
print(s)
print(mfe)
```
这个命令会对一个长度为40的序列进行RNA二级结构预测,并输出预测得到的二级结构和最小自由能。
如果你的序列仍然无法预测出二级结构,请检查序列是否正确并确保序列长度足够长。如果问题仍然存在,可能是因为你的RNA序列与ViennaRNA的参数设置不兼容,你可以尝试调整ViennaRNA的参数或使用其他的RNA分析工具。
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