asm_exp_dat <- extract_instruments(outcomes = 'ebi-a-GCST90014325') asm <- extract_instruments(outcomes = 'ebi-a-GCST90014325', clump = TRUE, r2 = 0.001, kb = 10000, access_token = NULL) #如果想要调整P值 asm_1 <- extract_instruments(outcomes = 'ebi-a-GCST90014325', p1 = 5e-08, clump = TRUE, r2 = 0.001, kb = 10000, access_token = NULL)bca_out <- extract_outcome_data( snps=data$SNP, outcomes='ieu-a-1127', proxies = FALSE, maf_threshold = 0.01, access_token = NULL ) mydata <- harmonise_data( exposure_dat=asm_1, outcome_dat=bca_out, action= 3 )Error in data$SNP : object of type 'closure' is not subsettable >我该如何修改？正确的代码是？

根据代码，你是想从 `data` 中提取 `SNP` 列，但是出现了错误。这个错误的原因可能是 `data` 不是一个数据框或数据表，而是一个函数。因此，你需要先执行 `data()` 函数，将数据加载到内存中，然后再提取 `SNP` 列。

修改后的代码如下：

data() # 加载数据
bca_out <- extract_outcome_data(
  snps = mydata$SNP, # 提取 mydata 数据框的 SNP 列
  outcomes = 'ieu-a-1127',
  proxies = FALSE,
  maf_threshold = 0.01,
  access_token = NULL
)

另外，你在上面的代码中使用了 `asm_1` 数据框，但是它没有在代码中定义。如果需要使用 `asm_1` 数据框，请先定义并赋值。

相关问题

Error: unexpected symbol in: "bca_out_dat <- extract_outcome_data(snps = asm_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-1127' bca_out"

这个错误是因为在代码行末尾缺少逗号或分号，导致R无法正确解析该行代码。你需要检查该行代码，并确保语法正确。在这行代码中，你漏掉了逗号，应该是这样的：

bca_out_dat <- extract_outcome_data(snps = asm_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-1127', bca_out)

请注意，我在 `outcomes` 和 `bca_out` 参数之间添加了逗号。

Error in extract_outcome_data(snps = asm_exp_dat$SNP, outcomes = "ieu-a-1127", : could not find function "extract_outcome_data"

这个错误是因为您使用的R程序没有安装包含`extract_outcome_data`函数的包。请确保您已经安装了包含该函数的包，并且加载了这个包，然后再次尝试运行该代码。如果您不知道包的名称，请查看代码中是否有包的引用或者使用搜索引擎搜索相关函数的包的名称。

例如，如果`extract_outcome_data`函数来自`gwascat`包，您可以使用以下代码来安装并加载该包：

install.packages("gwascat")
library(gwascat)

然后您应该可以使用`extract_outcome_data`函数了。