凝聚层次聚类算法实现(非聚类库函数调用),要求算法输入:随机生成聚类的>=20个一维对象;算法输出:分类结果,聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵。考虑三种不同距离计算方法进行聚类。
时间: 2023-06-29 09:15:11 浏览: 139
好的,凝聚层次聚类是一种自下而上的聚类算法,即每个对象都被看作一个独立的簇,然后逐渐合并簇,直到所有的簇都被合并成为一个大簇。在实现凝聚层次聚类算法时,我们需要考虑以下几个步骤:
1. 随机生成聚类的>=20个一维对象
我们可以使用Python中的numpy库来生成随机数,代码如下:
```python
import numpy as np
# 生成20个一维随机对象
dataset = np.random.rand(20)
```
2. 计算任意两个对象之间的距离
在凝聚层次聚类算法中,我们需要计算任意两个对象之间的距离。本文我们考虑三种不同的距离计算方法:欧几里得距离、曼哈顿距离和切比雪夫距离。代码如下:
```python
def euclidean_distance(x, y):
"""
计算欧几里得距离
"""
return np.sqrt(np.sum(np.square(x - y)))
def manhattan_distance(x, y):
"""
计算曼哈顿距离
"""
return np.sum(np.abs(x - y))
def chebyshev_distance(x, y):
"""
计算切比雪夫距离
"""
return np.max(np.abs(x - y))
# 任意两个对象之间的距离矩阵
dist_matrix = np.zeros((len(dataset), len(dataset)))
for i in range(len(dataset)):
for j in range(len(dataset)):
dist_matrix[i][j] = euclidean_distance(dataset[i], dataset[j])
```
3. 聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵
在进行聚类时,我们需要将任意两个距离最近的簇合并成为一个大簇,并更新距离矩阵。在这个过程中,我们需要记录下聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵。代码如下:
```python
def agglomerative_clustering(dataset, dist_matrix, method='single'):
"""
凝聚层次聚类算法
"""
# 初始化每个对象为一个簇
clusters = []
for i in range(len(dataset)):
clusters.append([i])
# 记录聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵
distances = []
for i in range(len(dataset)):
distances.append(list(dist_matrix[i]))
# 合并距离最近的簇,直到所有的簇都被合并成为一个大簇
while len(clusters) > 1:
# 找到距离最近的两个簇
min_dist = np.inf
merge_index = ()
for i in range(len(clusters)):
for j in range(i + 1, len(clusters)):
if distances[i][j] < min_dist:
min_dist = distances[i][j]
merge_index = (i, j)
# 合并距离最近的两个簇
new_cluster = clusters[merge_index[0]] + clusters[merge_index[1]]
clusters.pop(merge_index[1])
clusters[merge_index[0]] = new_cluster
# 更新距离矩阵
for i in range(len(clusters)):
if i != merge_index[0]:
if method == 'single':
# 单链接法
distances[merge_index[0]][i] = min(distances[merge_index[0]][i], distances[merge_index[1]][i])
elif method == 'complete':
# 全链接法
distances[merge_index[0]][i] = max(distances[merge_index[0]][i], distances[merge_index[1]][i])
else:
# 平均链接法
distances[merge_index[0]][i] = (distances[merge_index[0]][i] + distances[merge_index[1]][i]) / 2
distances[i][merge_index[0]] = distances[merge_index[0]][i]
distances.pop(merge_index[1])
return clusters[0], min_dist, dist_matrix
```
4. 分类结果
最后,我们可以调用上述函数进行聚类,并输出分类结果、聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵。代码如下:
```python
# 聚类
clusters, min_dist, dist_matrix = agglomerative_clustering(dataset, dist_matrix, method='single')
# 输出结果
print('分类结果:')
for i in range(len(clusters)):
print('簇', i + 1, ':', [dataset[j] for j in clusters[i]])
print('最短距离值:', min_dist)
print('距离矩阵:')
print(dist_matrix)
```
以上就是凝聚层次聚类算法的实现过程,包括随机生成聚类的一维对象、计算任意两个对象之间的距离、聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵、分类结果等。
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