ubuntu安装edgeR
时间: 2024-10-03 13:03:05 浏览: 16
EdgeR是一个专门用于RNA-seq数据分析的R包,它提供了生物统计方法来处理差异表达分析。要在Ubuntu系统上安装EdgeR,你需要先确保已经安装了必要的R环境以及Bioconductor库。以下是安装步骤:
1. **更新R和BiocManager**:
```sh
sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base r-recommended
R -e "install.packages('BiocManager', repos='http://cran.r-project.org')")
```
2. **安装BiocLite并加载Bioconductor**:
```sh
Rscript -e "if (!requireNamespace('BiocManager', quietly=TRUE)) install.packages('BiocManager')"
BiocManager::install()
```
3. **安装EdgeR**:
```
BiocManager::install("edgeR")
```
运行这行命令后,系统会自动从Bioconductor仓库下载并安装EdgeR包。
4. **加载和初始化**:
安装完成后,你可以通过下面的命令加载EdgeR包并检查是否安装成功:
```r
library(edgeR)
```
相关问题
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Edgar是美国证券交易委员会(SEC)的一个在线数据库系统,其中包括了上市公司向SEC提交的各种财务报表、年度报告、年度报告和其他公司文件。每家上市公司都有一个Edgar账号,可以通过该平台发布文件。
当我们搜索Edgar时,通常会看到各种公司的财务报表、年度报告、内部交易信息等结果。这些结果可以帮助投资者了解公司的财务状况、经营业绩和内部管理情况。此外,Edgar搜索结果也包括了公司提交的注册文件,如IPO文件、股权发行文件等,这对于投资者和分析师来说也具有重要的参考价值。
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sec edgar codes
Sec Edgar Codes 是指美国证券交易委员会(SEC)为了保持证券市场的透明度和监管的需要,为每家上市公司和注册投资者提供的一种标识编码系统。
SEC Edgar Codes 是一个由字母和数字组成的代码,用于标识不同的公司和投资者。其中包括公司的注册代码、投资者的识别代码等。通过这些代码,SEC可以追踪和监管每个公司和投资者的证券交易活动,确保市场的公平和有效。
对于上市公司来说,SEC Edgar Codes可以用来标识公司的注册信息和报表。投资者可以通过这些代码了解公司的注册和申报情况,以及公司的报表和财务信息,从而更好地了解和评估公司的价值和风险。
对于注册投资者来说,SEC Edgar Codes可以用来标识投资者的身份和交易活动。投资者可以通过自己的代码来提交交易申报和报表,以及接收公司的公告和通知。这些代码可以帮助SEC检查投资者的交易行为,保护投资者和市场的利益。
总而言之,SEC Edgar Codes 是一种用于标识上市公司和注册投资者的编码系统,可以帮助SEC监管和管理证券市场。这些代码的使用能够提高市场的透明度和监管效率,为投资者和公司提供更好的信息和保护。