对鸢尾花数据集进行聚类分析并绘制树形图
时间: 2023-07-10 22:14:27 浏览: 126
好的,我会为您提供一些关于鸢尾花数据集聚类分析的方法和步骤,并帮助您绘制树形图。
1. 下载鸢尾花数据集
鸢尾花数据集是一个经典的机器学习和数据挖掘数据集,您可以在网上找到多种来源。这里我以UCI Machine Learning Repository提供的数据集为例,您可以使用以下代码将其下载到您的本地:
```python
import urllib.request
url = "https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data"
filename = "iris.data"
urllib.request.urlretrieve(url, filename)
```
2. 加载数据集
接下来,您可以使用pandas库加载鸢尾花数据集:
```python
import pandas as pd
df = pd.read_csv("iris.data", header=None, names=["sepal_length", "sepal_width", "petal_length", "petal_width", "class"])
```
这里我们将数据集中的每一列分别命名为"sepal_length"、"sepal_width"、"petal_length"、"petal_width"和"class"。
3. 数据预处理
在进行聚类分析之前,我们需要对数据进行预处理。这里我们可以使用标准化方法将数据转换为均值为0、方差为1的标准正态分布:
```python
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
features = ["sepal_length", "sepal_width", "petal_length", "petal_width"]
x = df.loc[:, features].values
y = df.loc[:, ["class"]].values
x = StandardScaler().fit_transform(x)
```
4. 聚类分析
接下来,我们可以使用scikit-learn库中的KMeans算法进行聚类分析。这里我们选择将数据聚为3类:
```python
from sklearn.cluster import KMeans
kmeans = KMeans(n_clusters=3, random_state=0)
kmeans.fit(x)
```
5. 绘制树形图
最后,我们可以使用scikit-learn库中的dendrogram函数绘制树形图:
```python
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
import matplotlib.pyplot as plt
linked = linkage(x, 'ward')
plt.figure(figsize=(10, 7))
dendrogram(linked, orientation='top', distance_sort='descending', show_leaf_counts=True)
plt.show()
```
树形图将显示不同聚类之间的距离和样本数量,您可以根据需要进行调整。
以上就是对鸢尾花数据集进行聚类分析并绘制树形图的方法和步骤,希望能够帮助到您。
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