sce <- Read10X(data.dir = "D:/桌面/R/SKM.h5seurat") 错误于Read10X(data.dir = "D:/桌面/R/SKM.h5seurat"): Directory provided does not exist

在尝试使用`Read10X()`函数从H5格式的单细胞测序数据文件（如.SKM.h5）加载数据时，如果遇到了错误"Directory provided does not exist?"，说明指定的数据目录不存在。要解决这个问题，你需要确认以下几个步骤：

1. 检查文件路径：确保"data.dir"参数指向的实际路径是存在的。你可以通过直接访问该路径来验证，如果路径不存在，那么你需要修改它以指向正确的文件位置。

   data_dir <- "D:/桌面/R/SKM.h5seurat"
   if (!file.exists(data_dir)) {
       stop("指定的目录", data_dir, "不存在.")
   }

2. 如果文件已移动或重命名，确保你提供的新路径也是有效的。如果不是，你需要更新`data.dir`到新的文件位置。

3. 使用`file.choose()`或`browseURL()`等交互式方式让用户选择文件路径，以防输入错误。

data_dir <- file.choose(pattern = "*.h5seurat")
if (is.null(data_dir)) {
    stop("用户未选择文件，请再次选择.")
}

4. 如果`data.dir`指向的是一个文件而非目录，你应该修改为包含文件的目录。例如，如果是`SKM.h5seurat`这个文件，应该改为`"D:/桌面/R/"`。

完成上述检查和调整后，再尝试运行`Read10X()`函数：

my.data <- read10x_ymc(data.dir = data_dir, gene.column = 2, prefix = '', suffix = ".tsv")
sce <- CreateSeuratObject(counts = my.data, project = 'L1', min.cells = 3, min.features = 250)