R删除TCGA中样本最后编码为01B、01C的样本列

在R语言中，如果你想要从TCGA数据集中删除那些样本编码为01B和01C的列，你可以按照以下步骤操作：

1. 首先，加载你的TCGA数据集。假设你的数据存储在一个叫做`data`的数据框中：

library(TCGAbiolinks)
data <- getTCGAData("TARGET", normalize = TRUE) # 或者你的实际数据文件路径

2. 检查数据框的列名（或索引），找出哪些列的编码可能是"01B"或"01C"：

sample_cols <- names(data)[grepl("^(01B|01C)$", names(data))]

这里我们使用了正则表达式`grepl()`来查找匹配模式的列名。

3. 然后，使用`subset()`或`dplyr`包中的`select()`函数来创建新的数据框，只包含非"01B"和"01C"的列：

if (requireNamespace("dplyr", quietly = TRUE)) {
  data_cleaned <- data %>% select(-sample_cols)
} else {
  data_cleaned <- subset(data, select = -sample_cols)
}

`-sample_cols`表示移除指定的列。

4. 最后，确认你的新数据框没有包含编码为"01B"和"01C"的样本列：

head(data_cleaned, n = 5)