使用R语言CMplot包做多性状曼哈顿图代码

要使用`CMplot`包来绘制多性状曼哈顿图，首先需要确保已经安装了`CMplot`包。可以使用以下代码安装：

install.packages("CMplot")

然后，使用以下代码进行绘制多性状曼哈顿图：

library(CMplot)

# 定义数据
categories <- c('A', 'B', 'C', 'D')
values <- c(8, 5, 6, 9)

# 创建数据框
data <- data.frame(Category = categories, Value = values)

# 绘制多性状曼哈顿图
CMplot(data,
       chr = NULL, # 如果有染色体信息，可以在这里指定
       bp = NULL, # 如果有基因位置信息，可以在这里指定
       value = "Value", # y轴的值列名
       pvalue = NULL, # 如果有p值信息，可以在这里指定
       sig.level = 0.05, # 显著性水平
       threshold = NULL, # 显著性阈值
       legend.title = NULL, # 图例标题
       legend.breaks = NULL, # 图例分段
       legend.labels = NULL, # 图例标签
       legend.position = "bottom", # 图例位置
       title = "Multi-trait Manhattan Plot", # 图表标题
       xlab = "Categories", # x轴标签
       ylab = "Values" # y轴标签
)

这段代码将使用`CMplot`包创建一个多性状曼哈顿图，其中每个性状用点和柱状图表示。你可以根据自己的数据和需求进行修改和扩展。确保在运行代码之前已经安装了`CMplot`包。