%1.read data %2.notch filter & band-pass filter %3.rereference & channel selection %addpath(genpath('D:\toolbox\eeglab\functions')); %addpath(genpath('D:\toolbox\eeglab\plugins')); %addpath('I:/toolboxsum/fieldtrip'); ft_defaults; clc,clear; % set preprocessing parameter date ='DRM'; sub_selected=[7];%setdiff() run_num=6; ele_region = 'all'; ele_selection = 'yes'; hemisphere = 'both'; %preprocess parameters reref_type = 'avg';%['avg','bipolar']; band_filter = 'yes'; filter_type = 'band_pass'; notch_filter = 'yes'; p.notch_fre = [50 100 150 200];%Hz p.filter_limits= [0.5 200]; p.downsample_set=1; p.sr = 250; save_reref_data = 1; 解释一下
时间: 2024-04-18 07:31:52 浏览: 102
这段代码是一个数据预处理的流程,包括读取数据、陷波滤波和带通滤波、重新参考和通道选择。
首先,代码中添加了EEGLAB和FieldTrip工具箱的路径。这些工具箱提供了一些函数和工具来进行脑电数据分析和处理。
然后,设置了一些预处理参数。例如,`date`变量是一个字符串,用于标识数据集的日期;`sub_selected`是一个整数数组,用于选择特定的被试者;`run_num`是一个整数,用于指定运行次数;`ele_region`是一个字符串,用于指定电极区域;`ele_selection`是一个字符串,用于指定是否进行电极选择;`hemisphere`是一个字符串,用于指定脑半球。
接下来,设置了一些预处理的参数。例如,`reref_type`是一个字符串,用于指定重新参考的类型;`band_filter`是一个字符串,用于指定是否进行带通滤波;`filter_type`是一个字符串,用于指定滤波类型;`notch_filter`是一个字符串,用于指定是否进行陷波滤波;`p.notch_fre`是一个包含陷波滤波频率的数组;`p.filter_limits`是一个包含带通滤波频率范围的数组;`p.downsample_set`是一个整数,用于指定下采样倍数;`p.sr`是一个整数,用于指定采样率;`save_reref_data`是一个整数,用于指定是否保存重新参考后的数据。
以上是代码中的一些设置和参数说明,具体的数据处理步骤和函数调用可能需要进一步的代码。如果您有进一步的问题,请随时提问!
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%1.read data %2.notch filter & band-pass filter %3.rereference & channel selection %addpath(genpath('D:\toolbox\eeglab\functions')); %addpath(genpath('D:\toolbox\eeglab\plugins')); %addpath('I:/toolboxsum/fieldtrip'); ft_defaults; clc,clear; % set preprocessing parameter date ='DRM'; sub_selected=[7];%setdiff() run_num=6; ele_region = 'all'; ele_selection = 'yes'; hemisphere = 'both'; %preprocess parameters reref_type = 'avg';%['avg','bipolar']; band_filter = 'yes'; filter_type = 'band_pass'; notch_filter = 'yes'; p.notch_fre = [50 100 150 200];%Hz p.filter_limits= [0.5 200]; p.downsample_set=1; p.sr = 250; save_reref_data = 1;
您好!我发现您的代码中有一些数据处理的步骤和参数设置。您的第一个问题是关于读取数据的。是的,您可以使用EEGLAB工具箱中的函数来读取数据。您可以使用以下代码将EEGLAB函数添加到MATLAB路径中:
```matlab
addpath(genpath('D:\toolbox\eeglab\functions'));
addpath(genpath('D:\toolbox\eeglab\plugins'));
```
然后,您可以使用EEGLAB函数来读取数据,例如使用`pop_loadset`函数读取一个数据集文件:
```matlab
EEG = pop_loadset('filename', 'your_dataset.set', 'filepath', 'your_filepath');
```
请将"your_dataset.set"替换为您的数据集文件名,"your_filepath"替换为数据集文件的路径。
EEG.chanlocs(badchaninfo)=[]; EEG.nbchan=136; EEG.data(badchaninfo,:)=[]; for ichan=1:length(EEG.chanlocs) EEG.chanlocs(ichan).labels=EEG.chanlocs(ichan).labels(5:end); if ~isempty(strfind(EEG.chanlocs(ichan).labels,'-Ref')) EEG.chanlocs(ichan).labels=EEG.chanlocs(ichan).labels(1:end-4); end end % % for jchan=147:length(EEG.chanlocs) % EEG.chanlocs(jchan).labels=EEG.chanlocs(jchan).labels([1 3:end]); % EEG.chanlocs(jchan).labels=['c' EEG.chanlocs(jchan).labels]; % end %notch filter if strncmp(notch_filter,'yes',3) f_line = p.notch_fre; for fl = 1:length(f_line) data_tmp = double(EEG.data); data_nf = notchfilter(data_tmp, EEG.srate, f_line(fl)); EEG.data = data_nf; clear data_nf data_tmp end end %band-pass filter if strncmp(band_filter,'yes',3) data_f = ft_preproc_bandpassfilter(EEG.data,EEG.srate,p.filter_limits); EEG.data=data_f; clear data_f end %if isempty(EEG.chanlocs) %repalce ele names load(regions_file); ele_regions=ele_regions_data(subID).ele_regions; for i=1:EEG.nbchan if ~isempty(strfind(ele_regions{i,2},'_')) chan_name=strrep(ele_regions{i,2},'_',''); else chan_name=ele_regions{i,2}; end
这段代码的功能是对EEG数据进行一些预处理操作。
首先,根据`badchaninfo`变量中存储的坏道索引,删除EEG数据结构体中对应的通道信息。然后更新EEG数据结构体中的通道数`nbchan`和数据矩阵`data`。
接下来,通过遍历每个通道的索引,对EEG数据结构体中的通道标签进行处理。首先,删除每个通道标签的前五个字符;然后,如果通道标签中包含"-Ref",则删除末尾四个字符。
之后是陷波滤波的部分。如果`notch_filter`变量的前三个字符为"yes",则进行陷波滤波。使用`notchfilter`函数对数据进行陷波滤波,并将滤波后的数据存回EEG数据结构体。
接着是带通滤波的部分。如果`band_filter`变量的前三个字符为"yes",则进行带通滤波。使用`ft_preproc_bandpassfilter`函数对数据进行带通滤波,并将滤波后的数据存回EEG数据结构体。
最后是更新通道标签的部分。根据预先保存的电极区域信息文件`regions_file`,加载每个通道对应的区域信息。然后根据区域信息对通道标签进行修改,去除下划线和添加前缀。
代码中还有一段被注释掉的部分,似乎是用于替换电极名称的代码,可以根据需要取消注释并使用。
这些代码主要是对EEG数据进行了坏道处理、滤波操作和通道标签的修改。具体的函数实现可能需要进一步的代码。如果您有更多问题,请随时提问!
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