matlab用SPXY样本集划分后的结果如何用PCA得分图显示出来
时间: 2024-09-21 09:01:51 浏览: 50
在MATLAB中,当你使用`SPXY`函数对数据集进行了样本聚类(如通过`kmeans`、`partitionedKMeans`等),并且想将划分的结果与主成分分析(PCA)的得分图结合展示,通常步骤如下:
1. **数据处理**:
- 首先,你需要确保你的数据已经被预处理过了,包括归一化或标准化,因为PCA对数据的尺度非常敏感。
2. **样本聚类**:
- 使用`SPXY`或其他聚类算法对数据进行分组,并获得每个样本的类别标签。
3. **主成分分析**:
- 对整个数据集应用PCA,可以使用`pca`函数。这会返回一个包含主成分矩阵(`scores`变量)和对应得分的结构。
4. **添加聚类信息**:
- 将聚类标签与PCA得分对应起来,通常是将标签作为列向量,然后按照聚类分配到PCA得分上。
5. **绘制得分图**:
- 使用`scatter`或`gscatter`等函数,创建二维散点图,其中x轴和y轴分别是PCA的第一两个主成分(`scores(:,1)` 和 `scores(:,2)`)。不同颜色或标记表示不同的聚类。
6. **标注或显示分类结果**:
- 可能需要额外编写代码来在图中标注出不同聚类的区域或点的颜色/形状。
范例代码示例(假设`cluster_labels`是你的聚类标签,`scores`是PCA得分矩阵):
```matlab
% 加载并预处理数据
data = ...; % 替换为你的实际数据
[~, data] = preprocessData(data);
% 聚类
numClusters = ...; % 分成几类
[idx, ~] = kmeans(data, numClusters); % 或者用SPXY
% 主成分分析
[coeff, score, ~, ~] = pca(data);
% 绘制PCA得分图
figure;
gscatter(score(:,1), score(:,2), idx, 'rbcm', 'o'); % 'rbcm'代表红蓝绿黄四种颜色
hold on;
text(score(idx == 1, 1), score(idx == 1, 2), {'Cluster 1'}, 'Color', 'r');
text(score(idx == 2, 1), score(idx == 2, 2), {'Cluster 2'}, 'Color', 'b');
... (依此类推)
% 显示图例和标题
xlabel('PC1 Score');
ylabel('PC2 Score');
title('PCA Scores with Clustering Results');
% 清理多余图形
hold off;
```
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