supertree包，如何自定义绘图

Supertree是一个用于构建和可视化系统发生树的Python库，特别适合生物分类学中的应用。它的核心功能包括树的构建、分支长度调整和绘制美观的树形图。如果你想要在使用Supertree时自定义绘图样式，通常需要利用其提供的API结合Matplotlib或其他绘图库。

以下是一些基本步骤来自定义Supertree的绘图：

1. 导入必要的模块：

   import supertree
   import matplotlib.pyplot as plt

2. 创建SuperTree实例并构建树：

   model = ...  # 你的模型对象
   tree_data = ...  # 树的数据结构
   super_tree = supertree.SuperTree(model, tree_data)

3. 调用绘图函数，并传递自定义参数：

   fig, ax = plt.subplots(figsize=(width, height))
   
   # supertree.plot() 或者 specific method like super_tree.plot(ax=ax, **kwargs)
   # 其中kwargs可能包含如color_map, edge_color, node_size等属性来自定义颜色、边线和节点大小

示例：

   custom_colors = {'group1': 'blue', 'group2': 'red'}
   super_tree.plot(node_colors=custom_colors, ax=ax)

4. 自定义额外样式，如调整字体大小、添加标签等：

   for n in super_tree.treenode_iter():
       n.name_fontsize = 10

5. 显示或保存图表：

   plt.show()  # 显示
   plt.savefig('my_custom_tree.png')  # 保存到文件