Docking instance has no attribute 'ligMol'
时间: 2023-09-15 21:19:04 浏览: 1676
这个错误通常是因为你使用了一个没有正确初始化的 `Docking` 实例。在使用 `Docking` 进行分子对接之前,需要先通过 `set_ligand` 和 `set_receptor` 方法设置配体和受体分子。例如:
```python
from htmd.ui import *
d = Docking()
d.set_ligand('path/to/ligand.pdb')
d.set_receptor('path/to/receptor.pdb')
```
如果你已经执行了上述代码,仍然出现了 `Docking instance has no attribute 'ligMol'` 错误,可能是因为你在此之后更改了 `Docking` 实例的某些属性导致了错误的状态。建议重新创建一个新的 `Docking` 实例并重新设置配体和受体分子。
相关问题
autodock AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
根据问题描述,出现了一个名为"autodock"的AttributeError,错误信息显示"Docking instance has no attribute 'ligMol'"。这个错误表明在Docking实例中没有名为"ligMol"的属性。
根据引用,Autodock Vina在Windows平台没有Python安装方案,只提供了Linux和Mac OS版本。所以,如果你是在Windows平台上运行Autodock Vina的Python脚本,那么可能会遇到一些问题。可能的解决方案是使用虚拟机在Linux或Mac OS上安装并运行Autodock Vina的Python脚本。
另外,需要进一步分析你的代码以确定错误的原因。请确保你正确地初始化了Docking实例,并且在使用"ligMol"属性之前对其进行了赋值。可以检查一下代码中是否存在拼写错误或其他语法错误。
如果问题仍然存在,请提供更多的代码和错误堆栈信息,以便更好地帮助你解决问题。<span class="em">1</span><span class="em">2</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* [安装Python版本的Autodock Vina失败原因分析](https://blog.csdn.net/qq_37126941/article/details/115861381)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v92^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"]
[ .reference_list ]
autodock报错AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
这个错误提示表明在 Docking 实例中没有名为 ligMol 的属性。ligMol 是指配体分子,也就是需要进行分子对接的小分子。这个错误可能是因为你没有正确地设置配体分子。你需要检查一下你的代码,看看是否正确地设置了配体分子。
如果你已经正确设置了配体分子,但仍然出现这个错误,那么可能是因为你的 Docking 实例没有正确地初始化。你需要检查一下你的代码,看看是否正确地初始化了 Docking 实例。
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