Docking instance has no attribute 'ligMol'
时间: 2023-09-15 19:19:04 浏览: 585
这个错误通常是因为你使用了一个没有正确初始化的 `Docking` 实例。在使用 `Docking` 进行分子对接之前,需要先通过 `set_ligand` 和 `set_receptor` 方法设置配体和受体分子。例如:
```python
from htmd.ui import *
d = Docking()
d.set_ligand('path/to/ligand.pdb')
d.set_receptor('path/to/receptor.pdb')
```
如果你已经执行了上述代码,仍然出现了 `Docking instance has no attribute 'ligMol'` 错误,可能是因为你在此之后更改了 `Docking` 实例的某些属性导致了错误的状态。建议重新创建一个新的 `Docking` 实例并重新设置配体和受体分子。
相关问题
autodock4 AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
Autodock4是一种用于分子对接的计算工具,用于预测小分子与蛋白质之间的结合方式。根据你提供的错误信息,AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol',这个错误提示表明在Docking实例中没有名为'ligMol'的属性。
这个错误可能是由于以下几种情况引起的:
1. 你可能没有正确地初始化Docking实例或者没有正确设置'ligMol'属性。请确保在使用'ligMol'属性之前,已经正确地创建了Docking实例并设置了相应的属性。
2. 可能是拼写错误或者属性名称错误。请检查你的代码,确保属性名称拼写正确,并且与实际的属性名称一致。
3. 可能是Autodock4版本不兼容或者缺少某些依赖项。请确保你使用的是最新版本的Autodock4,并且已经正确安装了所有必要的依赖项。
如果你能提供更多的上下文信息或者代码片段,我可以更具体地帮助你解决这个问题。
AUTODOCK对接报错AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
关于您提到的AUTODOCK对接报错"AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'",这个错误通常是由于没有正确定义或者初始化`ligMol`导致的。`ligMol`是指待对接的小分子(ligand),它应该在对接之前被正确设置。
解决这个问题的方法是确保在对接之前正确设置了`ligMol`。你可以检查一下代码中是否有如下的步骤:
```python
docking = Docking()
docking.ligMol = your_ligand_molecule
```
其中`your_ligand_molecule`是你自己定义的小分子。
如果你已经正确设置了`ligMol`,那么可能是因为AUTODOCK版本不兼容或者存在其他问题。你可以尝试更新AUTODOCK或者查看相关文档以获取更多帮助。
希望能帮到您!如果您有其他问题,请随时提问。