IDI和NRI的R语言代码

IDI和NRI是评估医学诊断试验性能的指标。下面分别介绍其对应的R语言代码实现。

1. IDI指标

在R中，可以使用“PredictABEL”包来计算IDI指标。具体的步骤如下：

# 安装PredictABEL包
install.packages("PredictABEL")

# 加载PredictABEL包
library(PredictABEL)

# 构建两个模型：基础模型和扩展模型
fit1 <- lm(outcome ~ age + sex, data = mydata)
fit2 <- lm(outcome ~ age + sex + new_var, data = mydata)

# 计算IDI值
idi <- IDI(fit1, fit2, data = mydata)

其中，`mydata`是数据框，包含了需要用于构建模型的变量和因变量。

2. NRI指标

在R中，可以使用“nricens”包来计算NRI指标。具体的步骤如下：

# 安装nricens包
install.packages("nricens")

# 加载nricens包
library(nricens)

# 构建两个模型：基础模型和扩展模型
fit1 <- glm(outcome ~ age + sex, data = mydata, family = "binomial")
fit2 <- glm(outcome ~ age + sex + new_var, data = mydata, family = "binomial")

# 计算NRI值
nri <- nri(fit1, fit2, data = mydata, event = "outcome", threshold = 0.5)

其中，`mydata`是数据框，包含了需要用于构建模型的变量和因变量。`event`是指定事件的名称（比如二元分类问题中的阳性类别），`threshold`是指定分类阈值。