以鸢尾花数据为例，用C语言实现PCA算法，并求出每个主成分的贡献率

PCA（Principal Component Analysis）是一种常用的数据降维方法，它可以将高维数据转化为低维数据，同时保留原始数据的主要信息。在这里，我们以鸢尾花数据为例，介绍如何用C语言实现PCA算法，并求出每个主成分的贡献率。

首先，我们需要读取鸢尾花数据集。假设我们已经将数据存储在一个二维数组`data`中，其中每一行代表一条数据，每一列代表一个特征。我们可以使用以下代码读取数据：

float data[150][4]; // 鸢尾花数据集
FILE *fp;
fp = fopen("iris.data", "r");
for(int i=0; i<150; i++) {
    fscanf(fp, "%f,%f,%f,%f,%s", &data[i][0], &data[i][1], &data[i][2], &data[i][3], label);
}
fclose(fp);

接下来，我们需要对数据进行归一化处理，使每个特征的均值为0，标准差为1。归一化后的数据可以提高PCA算法的效果。归一化处理的代码如下：

float mean[4] = {0, 0, 0, 0}; // 均值
float std_dev[4] = {0, 0, 0, 0}; // 标准差

// 计算均值
for(int i=0; i<4; i++) {
    for(int j=0; j<150; j++) {
        mean[i] += data[j][i];
    }
    mean[i] /= 150;
}

// 计算标准差
for(int i=0; i<4; i++) {
    for(int j=0; j<150; j++) {
        std_dev[i] += (data[j][i] - mean[i]) * (data[j][i] - mean[i]);
    }
    std_dev[i] = sqrt(std_dev[i] / 149);
}

// 归一化数据
for(int i=0; i<4; i++) {
    for(int j=0; j<150; j++) {
        data[j][i] = (data[j][i] - mean[i]) / std_dev[i];
    }
}

接下来，我们可以计算数据的协方差矩阵。协方差矩阵可以反映数据之间的相关性，是PCA算法的关键。协方差矩阵的计算代码如下：

float cov[4][4] = {0}; // 协方差矩阵
// 计算协方差矩阵
for(int i=0; i<4; i++) {
    for(int j=0; j<4; j++) {
        for(int k=0; k<150; k++) {
            cov[i][j] += (data[k][i] * data[k][j]);
        }
        cov[i][j] /= 149;
    }
}

接下来，我们需要对协方差矩阵进行特征值分解，得到每个主成分的特征向量和特征值。特征向量代表每个主成分的方向，特征值代表该方向上的重要程度。特征值越大，代表该方向上的信息量越多，对应的主成分的贡献率也越高。特征值分解的代码如下：

float eigenvalues[4]; // 特征值
float eigenvectors[4][4]; // 特征向量

// 计算特征值和特征向量
jacobi(cov, eigenvalues, eigenvectors, 4);

// 对特征值从大到小排序
sort_eigenvalues(eigenvalues, eigenvectors, 4);

最后，我们可以根据特征向量和数据计算出每个主成分，并计算每个主成分的贡献率。主成分的计算和贡献率的计算代码如下：

float principal_components[4][150]; // 主成分
float contribution_rate[4]; // 贡献率

// 计算主成分
for(int i=0; i<4; i++) {
    for(int j=0; j<150; j++) {
        principal_components[i][j] = 0;
        for(int k=0; k<4; k++) {
            principal_components[i][j] += eigenvectors[i][k] * data[j][k];
        }
    }
}

// 计算贡献率
for(int i=0; i<4; i++) {
    contribution_rate[i] = eigenvalues[i] / (eigenvalues[0] + eigenvalues[1] + eigenvalues[2] + eigenvalues[3]);
}

完整的PCA算法代码如下：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <math.h>

void jacobi(float a[][4], float d[], float v[][4], int n)
{
    int j,iq,ip,i;
    float tresh,theta,tau,t,sm,s,h,g,c,b[4],z[4];
    for(ip=0;ip<n;ip++)
    {
        for(iq=0;iq<n;iq++)
            v[ip][iq]=0.0;
        v[ip][ip]=1.0;
    }
    for(ip=0;ip<n;ip++)
    {
        b[ip]=d[ip]=a[ip][ip];
        z[ip]=0.0;
    }
    for(i=1;i<=50;i++)
    {
        sm=0.0;
        for(ip=0;ip<n-1;ip++)
        {
            for(iq=ip+1;iq<n;iq++)
                sm += fabs(a[ip][iq]);
        }
        if(sm == 0.0)
        {
            return;
        }
        if(i<4)
            tresh=0.2*sm/(n*n);
        else
            tresh=0.0;
        for(ip=0;ip<n-1;ip++)
        {
            for(iq=ip+1;iq<n;iq++)
            {
                g=100.0*fabs(a[ip][iq]);
                if(i > 4 && (float)(fabs(d[ip])+g) == (float)fabs(d[ip])
                   && (float)(fabs(d[iq])+g) == (float)fabs(d[iq]))
                {
                    a[ip][iq]=0.0;
                }
                else if(fabs(a[ip][iq]) > tresh)
                {
                    h=d[iq]-d[ip];
                    if((float)(fabs(h)+g) == (float)fabs(h))
                    {
                        t=(a[ip][iq])/h;
                    }
                    else
                    {
                        theta=0.5*h/(a[ip][iq]);
                        t=1.0/(fabs(theta)+sqrt(1.0+theta*theta));
                        if(theta < 0.0)
                            t = -t;
                    }
                    c=1.0/sqrt(1+t*t);
                    s=t*c;
                    tau=s/(1.0+c);
                    h=t*a[ip][iq];
                    z[ip] -= h;
                    z[iq] += h;
                    d[ip] -= h;
                    d[iq] += h;
                    a[ip][iq]=0.0;
                    for(j=0;j<ip;j++)
                    {
                        ROTATE(a,j,ip,j,iq)
                    }
                    for(j=ip+1;j<iq;j++)
                    {
                        ROTATE(a,ip,j,j,iq)
                    }
                    for(j=iq+1;j<n;j++)
                    {
                        ROTATE(a,ip,j,iq,j)
                    }
                    for(j=0;j<n;j++)
                    {
                        ROTATE(v,j,ip,j,iq)
                    }
                }
            }
        }
        for(ip=0;ip<n;ip++)
        {
            b[ip] += z[ip];
            d[ip]=b[ip];
            z[ip]=0.0;
        }
    }
}

void sort_eigenvalues(float eigenvalues[], float eigenvectors[][4], int n)
{
    float temp_value;
    float temp_vector[4];
    for(int i=0; i<n-1; i++) {
        for(int j=i+1; j<n; j++) {
            if(eigenvalues[j] > eigenvalues[i]) {
                temp_value = eigenvalues[i];
                eigenvalues[i] = eigenvalues[j];
                eigenvalues[j] = temp_value;
                for(int k=0; k<n; k++) {
                    temp_vector[k] = eigenvectors[k][i];
                    eigenvectors[k][i] = eigenvectors[k][j];
                    eigenvectors[k][j] = temp_vector[k];
                }
            }
        }
    }
}

int main()
{
    float data[150][4]; // 鸢尾花数据集
    FILE *fp;
    fp = fopen("iris.data", "r");
    for(int i=0; i<150; i++) {
        fscanf(fp, "%f,%f,%f,%f,%s", &data[i][0], &data[i][1], &data[i][2], &data[i][3], label);
    }
    fclose(fp);

    float mean[4] = {0, 0, 0, 0}; // 均值
    float std_dev[4] = {0, 0, 0, 0}; // 标准差

    // 计算均值
    for(int i=0; i<4; i++) {
        for(int j=0; j<150; j++) {
            mean[i] += data[j][i];
        }
        mean[i] /= 150;
    }

    // 计算标准差
    for(int i=0; i<4; i++) {
        for(int j=0; j<150; j++) {
            std_dev[i] += (data[j][i] - mean[i]) * (data[j][i] - mean[i]);
        }
        std_dev[i] = sqrt(std_dev[i] / 149);
    }

    // 归一化数据
    for(int i=0; i<4; i++) {
        for(int j=0; j<150; j++) {
            data[j][i] = (data[j][i] - mean[i]) / std_dev[i];
        }
    }

    float cov[4][4] = {0}; // 协方差矩阵

    // 计算协方差矩阵
    for(int i=0; i<4; i++) {
        for(int j=0; j<4; j++) {
            for(int k=0; k<150; k++) {
                cov[i][j] += (data[k][i] * data[k][j]);
            }
            cov[i][j] /= 149;
        }
    }

    float eigenvalues[4]; // 特征值
    float eigenvectors[4][4]; // 特征向量

    // 计算特征值和特征向量
    jacobi(cov, eigenvalues, eigenvectors, 4);

    // 对特征值从大到小排序
    sort_eigenvalues(eigenvalues, eigenvectors, 4);

    float principal_components[4][150]; // 主成分
    float contribution_rate[4]; // 贡献率

    // 计算主成分
    for(int i=0; i<4; i++) {
        for(int j=0; j<150; j++) {
            principal_components[i][j] = 0;
            for(int k=0; k<4; k++) {
                principal_components[i][j] += eigenvectors[i][k] * data[j][k];
            }
        }
    }

    // 计算贡献率
    for(int i=0; i<4; i++) {
        contribution_rate[i] = eigenvalues[i] / (eigenvalues[0] + eigenvalues[1] + eigenvalues[2] + eigenvalues[3]);
    }

    // 输出每个主成分的贡献率
    for(int i=0; i<4; i++) {
        printf("主成分%d的贡献率为：%.2f%%\n", i+1, contribution_rate[i]*100);
    }

    return 0;
}