R语言怎么psm倾向性评分并得出独立危险因素和风险比
时间: 2024-03-31 14:09:27 浏览: 145
在 R 语言中,进行倾向性评分匹配(Propensity Score Matching,PSM)可以使用 `MatchIt` 包。以下是一个简单的示例代码来执行 PSM,然后得出独立危险因素和风险比:
首先,确保已安装 `MatchIt` 包:
```R
install.packages("MatchIt")
```
接下来,加载所需的库和数据集。假设你有一个名为 `data` 的数据框,其中包含所有的自变量和因变量:
```R
library(MatchIt)
# 加载数据
data <- read.csv("your_data.csv")
```
然后,使用 `matchit()` 函数创建倾向性评分匹配对象,并指定因变量和自变量:
```R
# 创建倾向性评分匹配对象
psm_model <- matchit(treatment ~ x1 + x2 + x3, data = data)
```
在这里,`treatment` 是一个二元的处理变量,表示是否接受了某种干预。`x1`、`x2` 和 `x3` 是自变量。
接下来,使用 `match.data()` 函数基于倾向性评分匹配对象获取匹配后的数据集:
```R
# 获取匹配后的数据集
matched_data <- match.data(psm_model)
```
现在,你可以使用匹配后的数据集来计算独立危险因素和风险比。一种常见的方法是使用 `table()` 函数计算各组中的因变量的频数,并使用 `prop.table()` 函数计算风险比:
```R
# 计算各组中因变量的频数
table(matched_data$treatment, matched_data$outcome)
# 计算风险比
risk_ratio <- prop.table(table(matched_data$treatment, matched_data$outcome), margin = 1)[2, 2] / prop.table(table(matched_data$treatment, matched_data$outcome), margin = 1)[1, 2]
```
这里假设 `outcome` 是你感兴趣的因变量。
希望这个简单的例子能帮助你进行 PSM 并计算独立危险因素和风险比。请根据你的具体数据和需求进行相应的修改。
阅读全文