在不使用python的EMD包的前提下帮我复现python的EMD完整算法
时间: 2024-10-19 14:06:55 浏览: 18
python emd算法
Earth Mover's Distance (EMD) 或称为 Wasserstein 距离是一种衡量两个概率分布之间“距离”的方法,它考虑了将一种分布转换成另一种分布所需的最小工作量。在Python中,如果没有直接使用的EMD包如`scipy.stats.wasserstein_distance`,你可以手动实现基本步骤:
1. **计算累积分布函数** (CDFs): 对于两个输入的概率分布P和Q,首先需要得到它们的累积分布函数。
```python
def cdf(values):
values = sorted(values)
cum_dist = np.cumsum(values / sum(values))
return values, cum_dist
def compute_cdfs(dist1, dist2):
return cdf(dist1), cdf(dist2)
```
2. **分配代价矩阵**: 根据两组CDF创建一个二维数组,元素值表示从一个累积点移动到另一个累积点的成本。
```python
def allocate_costs(cdf_p, cdf_q):
cost_matrix = np.abs(np.outer(cdf_p[1], 1 - cdf_q[1]))
return cost_matrix
```
3. **构造运输图**: 这是一个二维网格,其中每个单元格代表从一个累积点到另一个累积点的一个单位转移。
4. **找到最短路径**: 使用经典的匈牙利算法(也称Kuhn-Munkres算法)来寻找成本最低的匹配策略,将其转换为EMD。
```python
from scipy.optimize import linear_sum_assignment as hungarian_algorithm
def emd(dist1, dist2):
cdf_p, cdf_q = compute_cdfs(dist1, dist2)
cost_matrix = allocate_costs(cdf_p, cdf_q)
row_ind, col_ind = hungarian_algorithm(cost_matrix)
emd_value = cost_matrix[row_ind, col_ind].sum()
return emd_value
```
注意:这个实现没有优化过程,适用于小型数据集。对于大型数据,可以考虑使用更高效的库或者专门的EMD实现。
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