Linux如何卸载之前编译安装的ViennaRNA-2.5.0重新安装并添加环境变量使得可以import RNA
时间: 2024-03-07 18:48:36 浏览: 18
如果你之前是通过源码编译安装的ViennaRNA-2.5.0,可以使用以下方法重新安装并添加环境变量:
1. 卸载之前的ViennaRNA-2.5.0
使用以下命令卸载之前编译安装的ViennaRNA-2.5.0:
```
cd /path/to/ViennaRNA-2.5.0
sudo make uninstall
```
其中`/path/to/ViennaRNA-2.5.0`是ViennaRNA-2.5.0的源码目录。
2. 重新编译安装ViennaRNA-2.5.0
下载ViennaRNA-2.5.0的源码,解压缩后进入源码目录,执行以下命令进行编译安装:
```
./configure
make
sudo make install
```
3. 添加环境变量
将ViennaRNA-2.5.0的安装路径添加到系统的环境变量中。可以在终端中使用以下命令:
```
echo 'export PATH=/usr/local/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
```
其中`/usr/local/bin`是ViennaRNA-2.5.0的安装路径。执行完成后,再次运行`which RNAfold`命令验证ViennaRNA-2.5.0的安装路径是否已经添加到系统的环境变量中。
4. 测试环境
在Python中使用`import RNA`命令导入ViennaRNA-2.5.0,如果没有报错,则表示ViennaRNA-2.5.0已经成功安装并添加到系统的环境变量中。
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Linux如何卸载之前编译安装的ViennaRNA-2.5.0
如果你之前是通过源码编译安装的ViennaRNA-2.5.0,可以使用以下命令卸载ViennaRNA-2.5.0:
1. 进入ViennaRNA-2.5.0源码目录
在终端中进入ViennaRNA-2.5.0源码目录:
```
cd /path/to/ViennaRNA-2.5.0
```
其中`/path/to/ViennaRNA-2.5.0`是ViennaRNA-2.5.0的源码目录。
2. 执行uninstall命令
在ViennaRNA-2.5.0源码目录中执行以下命令:
```
sudo make uninstall
```
该命令会将之前编译安装的ViennaRNA-2.5.0卸载。执行完成后,你可以使用`which RNAfold`命令确认ViennaRNA-2.5.0已经被成功卸载。
如果以上方法无法卸载ViennaRNA-2.5.0,你可以尝试手动删除ViennaRNA-2.5.0的安装文件和目录,包括:
- 安装目录(默认为`/usr/local`)
- `/usr/local/share/man/man1`目录下的RNAfold相关的man文件
- `/usr/local/bin`目录下的RNAfold相关的可执行文件
删除完成后,你可以使用`which RNAfold`命令确认ViennaRNA-2.5.0已经被成功卸载。
下载ViennaRNA-2.5.0的安装包编译安装后,RNAfold -h报错
如果你已经通过编译安装的方式安装了ViennaRNA-2.5.0,但是在运行`RNAfold -h`命令时仍然报错,可以尝试以下几个方法:
1. 确认安装路径
检查一下ViennaRNA-2.5.0的安装路径是否正确。你可以在终端中使用以下命令查找RNAfold的安装路径:
```
which RNAfold
```
如果终端输出了RNAfold的安装路径,则可以确认安装路径是否正确。
2. 设置环境变量
如果ViennaRNA-2.5.0的安装路径正确,但是`RNAfold -h`命令仍然报错,可以尝试设置ViennaRNA-2.5.0的环境变量。你可以在终端中使用以下命令设置环境变量:
```
export PATH=$PATH:/path/to/ViennaRNA-2.5.0/bin
```
其中`/path/to/ViennaRNA-2.5.0`是ViennaRNA-2.5.0的安装路径。设置完成后,再次运行`RNAfold -h`命令,如果终端输出RNAfold的帮助信息,则表示设置环境变量成功。
3. 重新编译安装
如果以上方法都无法解决问题,可以尝试重新编译安装ViennaRNA-2.5.0。在编译安装之前,可以先使用以下命令清除之前的安装文件:
```
make uninstall
```
清除完成后,重新编译安装ViennaRNA-2.5.0,然后再次运行`RNAfold -h`命令,看是否能够正常运行。