使用matio追加数据时发现内部使用的是hdf5存入,但是hdf5扩容使用的是2倍扩容,如何修改
时间: 2024-01-24 20:20:37 浏览: 65
matio库是基于HDF5库的,因此在使用matio库中的追加数据功能时,会使用HDF5库的扩容机制。默认情况下,HDF5会使用2倍扩容机制,这是因为这种方式能够更有效地利用磁盘空间,从而提高性能。
如果你需要修改HDF5的扩容机制,可以使用HDF5的API来进行设置。具体来说,可以使用`H5Pset_alloc_time()`函数来设置内存和磁盘空间的分配时间,以及`H5Pset_fill_value()`函数来设置数据集的填充值和填充方式。其中,`H5Pset_alloc_time()`函数接受三个参数:属性列表,内存空间分配时间和磁盘空间分配时间。如果将磁盘空间分配时间设置为H5D_ALLOC_TIME_EARLY,则会在数据集创建时就为其分配足够的磁盘空间,从而避免在追加数据时进行扩容。而`H5Pset_fill_value()`函数则可以设置数据集的填充值和填充方式,可以根据实际情况进行选择。
需要注意的是,修改HDF5的扩容机制可能会影响性能和空间利用率,因此需要根据实际情况进行选择。
相关问题
使用matio追加数据时发现内部使用的是hdf5存入,但是hdf5扩容使用的是2倍扩容,如何修改成存入多少数据就扩容多少
matio库中使用的是hdf5进行存储,hdf5默认采用的是2倍扩容策略。如果需要修改为存入多少数据就扩容多少,需要按照以下步骤操作:
1. 打开matio源代码中的`matio_private.h`文件,找到以下定义:
```
#define MATIO_H5_EXPAND_MAX 2
```
2. 将其中的2改为1或者其他需要的扩容因子,例如改为4。
3. 重新编译matio库。
这样修改后,使用matio库进行追加数据时,就会按照存入的数据量扩容,而不是按照2倍扩容了。
使用matio中的hdf5追加数据时如何扩容文件大小
如果你想在使用matio中的hdf5追加数据时扩容文件大小,可以使用H5Fset_file_size函数来实现。
具体步骤如下:
1.打开hdf5文件,可以使用H5Fopen或H5Fcreate函数。
2.使用H5Fset_file_size函数设置文件的大小,该函数的参数为文件ID和新文件大小(以字节为单位)。
3.写入数据到文件中,可以使用H5Dwrite或H5Dappend函数。
4.关闭文件,可以使用H5Fclose函数。
下面是一个示例代码:
```c
#include <stdio.h>
#include "matio.h"
#include "hdf5.h"
int main(int argc, char **argv)
{
mat_t *matfp;
matvar_t *matvar;
hid_t file_id, dataset_id, dataspace_id, memspace_id;
hsize_t dims[2] = {10, 10};
int data[10][10] = {{0}};
/* Open mat file */
matfp = Mat_Open("test.mat", MAT_ACC_RDWR);
if (matfp == NULL) {
printf("Error opening mat file\n");
return 1;
}
/* Open hdf5 file */
file_id = H5Fopen("test.h5", H5F_ACC_RDWR, H5P_DEFAULT);
if (file_id < 0) {
printf("Error opening hdf5 file\n");
return 1;
}
/* Set new file size */
hsize_t new_size = 1024 * 1024;
herr_t status = H5Fset_file_size(file_id, new_size);
if (status < 0) {
printf("Error setting file size\n");
return 1;
}
/* Write data to dataset */
dataspace_id = H5Screate_simple(2, dims, NULL);
dataset_id = H5Dopen2(file_id, "data", H5P_DEFAULT);
memspace_id = H5Screate_simple(2, dims, NULL);
status = H5Dwrite(dataset_id, H5T_NATIVE_INT, memspace_id, dataspace_id, H5P_DEFAULT, data);
if (status < 0) {
printf("Error writing data to dataset\n");
return 1;
}
/* Close hdf5 file */
H5Sclose(dataspace_id);
H5Dclose(dataset_id);
H5Fclose(file_id);
/* Close mat file */
Mat_Close(matfp);
return 0;
}
```
在这个示例代码中,我们首先打开了一个mat文件,然后打开了一个hdf5文件。接着使用H5Fset_file_size函数设置文件的大小为1MB,然后写入了一个10x10的数据到名为"data"的dataset中。最后关闭了文件。
需要注意的是,扩容文件大小可能会导致文件损坏或数据丢失,所以在使用H5Fset_file_size函数时需要谨慎处理。
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