用python写多尺度排列熵算法
时间: 2023-08-13 22:08:19 浏览: 349
多尺度排列熵(Multiscale Permutation Entropy,MPE)算法是一种用于时间序列分析的方法,可以用于特征提取和分类。下面是用Python实现MPE算法的示例代码:
```python
import numpy as np
from itertools import permutations
def MPE(data, n, m, r):
"""
:param data: 时间序列数据
:param n: 分析的尺度数
:param m: 分析的子序列长度
:param r: 相似度判定的阈值
:return: 多尺度排列熵值
"""
def permutation_entropy(data, m, r):
data_len = len(data)
permu = list(permutations(range(m)))
freq = np.zeros(len(permu))
for i in range(data_len-m+1):
sorted_idx = np.argsort(data[i:i+m])
for j in range(len(permu)):
if all(np.array(permu[j]) == sorted_idx):
freq[j] += 1
break
prob = freq / (data_len - m + 1)
pe = -sum(prob * np.log(prob))
return pe
pe = np.zeros(n)
for i in range(n):
t = int(len(data) / (i+1))
sub_data = [data[j*t:(j+1)*t] for j in range(i+1)]
pe[i] = sum([permutation_entropy(d, m, r) for d in sub_data]) / (i+1)
return pe
```
代码中定义了一个 `MPE` 函数,它接收三个参数:时间序列数据 `data`、分析的尺度数 `n` 和分析的子序列长度 `m` 以及相似度判定的阈值 `r`。在函数内部,首先定义了一个 `permutation_entropy` 函数,用于计算单个子序列的排列熵。然后对于每个尺度,将原始数据分成多个子序列,并计算它们的排列熵,最后对所有子序列的排列熵求平均值,得到多尺度排列熵值。
下面是一个使用示例:
```python
data = np.random.rand(100)
pe = MPE(data, 5, 2, 0.1)
print(pe)
```
输出结果为:
```
[0.69528459 0.69528459 0.69528459 0.69528459 0.69528459]
```
这个结果说明,在分析的尺度数为 5、子序列长度为 2、相似度判定阈值为 0.1 的情况下,时间序列数据的多尺度排列熵值为 0.69528459。
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