这里有一份数据其中有九个变量,利用七个变量:YrHgt,FtFtBody,PrctFFB,Frame,BkFat,sALEhThe和SaleWt,这七个变量分别对应数据的后七列,进行分析,样本协方差矩阵为s,这里有部分代码: data <- read.table("T1-10.dat") 请给出r语言代码:要求是用样本协方差矩阵s做主成分分析,利用累计贡献率,确定前五个主成分,写出所选择的样本主成分的表达式并绘制双标图
时间: 2023-06-20 15:06:19 浏览: 195
可以使用 R 语言中的 `prcomp` 函数进行主成分分析,代码如下:
```
# 读取数据
data <- read.table("T1-10.dat")
# 提取需要分析的七个变量
data_pca <- data[, 2:8]
# 计算样本协方差矩阵
s <- cov(data_pca)
# 进行主成分分析,并选择前5个主成分
pca_result <- prcomp(data_pca, scale = TRUE)
pca_result <- pca_result$x[, 1:5]
# 计算每个主成分的累计贡献率
cumulative_var <- cumsum(pca_result$sdev^2 / sum(pca_result$sdev^2))
# 输出每个主成分的表达式
for (i in 1:5) {
cat(paste0("PC", i, ": "))
for (j in 1:7) {
cat(paste0(pca_result[j, i], "*X", j))
if (j < 7) {
cat(" + ")
}
}
cat("\n")
}
# 绘制双标图
biplot(pca_result, scale = 0, cex = 0.8, col = "gray")
```
其中,`prcomp` 函数中的 `scale=TRUE` 表示对数据进行标准化,使得每个变量的均值为0,标准差为1。`pca_result$x[, 1:5]` 表示提取前5个主成分。`pca_result$sdev` 表示主成分的标准差。`cumsum(pca_result$sdev^2 / sum(pca_result$sdev^2))` 表示计算每个主成分的累计贡献率。`biplot` 函数用于绘制双标图,其中 `scale = 0` 表示不对数据进行标准化,`cex = 0.8` 表示调整字体大小,`col = "gray"` 表示设置点和箭头的颜色为灰色。
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